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Structural studies of inhibition mechanism of TRPV3 target inhibitors byCryo-EM

Structural studies of inhibition mechanism of TRPV3 target inhibitors byCryo-EM
Cryo-EM对TRPV3靶点抑制剂抑制机制的结构研究
批准号:
20J13609
负责人:
島田 寛人
金额:
$1.47万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-24 至 2022-03-31

项目摘要

项目成果

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本研究ではTRPV3阻害剤のTRPV3阻害機構モデルを提唱することで、TRPV3をターゲットとした新規阻害剤設計に有用な情報を与えることを最終目標としていた。TRPV3-74aが2021年2月に発表され、構造解析系の条件を検討した。TRPV3-74aを添加した状態で構造解析を行い、2.9Åの分解能のマップが再構成された。しかし、TRPV3-74aとTRPV3の結合が見られなかったことから、TRPV3阻害剤とTRPV3の結合状態を見る構造解析を断念した。その方針の代替として、昨年度よりTRPVファミリーのヴァニロイド選択性を解明することで、TRPV3のリガンド結合に対する構造生物学的知見を得ることを計画し、侵攻している。ヴァニロイド化合物の一種でTRPV1選択的アゴニストであるレジニフェラトキシンはTRPV3を活性化しない。TRPV3のF656I変異体はレジニフェラトキシン応答性を獲得する。構造比較を行った所、野生型のTRPV3に結合する脂質が、TRPV1のレジニフェラトキシン結合状態の構造におけるレジニフェラトキシンの位置にアシル鎖の一部が存在することが判明した。この脂質はF656I変異体においては移動しており、レジニフェラトキシン結合ポケットと被らない位置にある。このことから、TRPV3の周辺に結合する脂質が、TRPV3のリガンド選択性に寄与している可能性を示唆した。TRPV3のF656I変異体に対してレジニフェラトキシンを添加したところ、分解能4.8Åのマップが得られたが、膜貫通ドメインの部分の密度がモデリングに十分ではなかった。そのため、今後はTRPV3のF656I変異体に対してNanodisc再構成を行う際に環状MSPを用いたNanodiscなどを用いて、F656I変異体の性状を変化させることが必要だと考えている。
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会议论文
TRPV3ナノディスク複合体の構造解析によるTRPV3活性化機構の解明
通过 TRPV3 纳米盘复合物的结构分析阐明 TRPV3 激活机制
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [山田 満月, 松田 知華, 島田 寛人]
通讯作者: 島田 寛人
DOI: 10.1038/s41594-020-0439-z
发表时间: 2020-06-22
期刊: NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY
影响因子: 16.8
作者: [Shimada, Hiroto, Kusakizako, Tsukasa, Nureki, Osamu]
通讯作者: Nureki, Osamu
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