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接合藻ヒメミカヅキモの生殖様式の進化：生殖様式転換実験と全ゲノム解析から探る

合子藻 Hymemikadukimo 生殖模式的进化：通过生殖模式转换实验和全基因组分析进行探索

基本信息

批准号：
20J20877
负责人：
川口也和子
金额：
$ 1.98万
依托单位：
Chiba University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-24 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20J20877/
关键词：
藻類ゲノム種内多様性遺伝子重複生殖様式全ゲノム解析

项目摘要

本研究は、単細胞性藻類であるヒメミカヅキモ(Closterium peracerosum-strigosum-littorale complex)の野生系統を用いて、そのゲノム比較及び発現量比較を行うものである。種内22系統のショートリードシーケンスデータに基づくゲノムサイズ比較により、性に関連しないダイナミックなゲノムサイズ変異の存在が明らかとなった。６系統についてロングリードシーケンスによる詳細な配列比較を行ったところ、ゲノムサイズ変異は性に関連するゲノム領域や繰り返し配列ではなく、ゲノムワイドに見られるコピー数変異に由来することが判明した。そのコピー数変異を招いた大規模な重複は少なくとも種内で４回起きており、そのうち１系統は由来の異なる３つのゲノムがキメラ上に混ざっているゲノムを持つことがわかった。さらにコピー数変異のある遺伝子には機能的な偏りが見られ、特にステージ特異的な発現を示す遺伝子セットにより集中していることがわかった。加えて、３０％の遺伝子においては、コピー数変異に比例しない発現量比がみられ、遺伝子量補償が機能していることが示唆されたとともにそれらが翻訳に関わる遺伝子に集中していることが明らかとなった。本研究は、ヒメミカヅキモがゲノムサイズ多型とコピー数変異による影響を解き明かす、新たなモデル生物となることを示した。これらの成果を、日本進化学会にて主催したシンポジウムにて発表したほか、学術論文としてまとめ、国際誌に投稿中である。

In this study, we compared the wild system of monocellular algae (Clostridium peracerosum-strigosum-littorale complex) with the wild system, and compared its occurrence. In 22 species, there are differences in the system's structure and characteristics. 6. To determine the origin of the differences between the two groups, we should compare the differences between the two groups. The number of different types of fish is different. The number of fish is different. The number of different types of information is different from the number of types of information. The number of types of information is different from the number of types of information. Add 30% of the total amount of money to the total amount of money This study shows the effects of different types of organisms. These results have been published in the main forum of the Evolutionary Society of Japan, in academic papers, and in contributions to the International Journal.