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Diversification process in the deep-sea benthos

深海底栖生物的多样化过程

基本信息

批准号：
20J22102
负责人：
石山玄樹
金额：
$ 1.98万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-24 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

2022年度はチヂワバイ属貝類の多様化過程解明に向けて、主に以下の内容について実施した。・化石標本を用いたチヂワバイ類の分岐年代推定：前年度に分類と出現年代を整理した、化石として出現する6種の情報を参考に分岐年代推定を行い，多様化時期や分散速度について検討した。とりわけ本属最古の化石である中期中新世の化石を主たる較正に用いた。その結果得られた系統樹より、COI遺伝子領域の分子進化速度は0.63 %/Myrと、他の分類群の値よりも遅い傾向にあると推定された。さらに、異所的に生じた分岐について、本属貝類は水平方向に80-220 km/Myrと非常に遅い速度で分散してきたと推定された。・SNPs解析による高解像度な遺伝的分化過程の解析：種内の遺伝的分化過程について、前年度まではサンガーシーケンサーによる解析に留まっていたこともあり明らかになっていなかった。そこで、現状最も個体数が多く、分布域が水平的かつ垂直的に幅広い種について、網羅的にSNPs解析を行い、集団構造を明らかにした。その結果、大きく3つの集団に分かれ、浅所の釧路・襟裳沖集団と東北沖集団は地理的隔離による分化と考えられる一方で、東北集団内では水深差による遺伝的分化が生じていると推定された。この結果からより強固な議論をするためには、釧路・襟裳沖の水深2000 m付近の個体を解析に加える必要がある。・KH-22-8航海による新たなサンプル採集：9月30日から10月17日までの期間に、研究船「白鳳丸」に乗船し、襟裳沖の漸深海帯から超深海帯（2000-8000 m）の深海底生生物調査に参加した。この航海で、チヂワバイ類の生貝標本4種8個体を得た。特に、「SNPs解析による高解像度な遺伝的分化過程の解析」にて不足していた襟裳沖2000 mの標本が得られた。2023年度の採用延長期間中にこのSNPsを取得し、解析を行う予定である。

In 2022, the diversification process of shellfish of the genus Shellfish will be explained and explained, and the following content will be explained.・Estimation of the age of the divergence of the fossil specimens using the classification system: Classification and emergence age of the previous year, sorting out the fossils The emergence of six types of information is based on the estimation of the age of the bifurcation and the speed of dispersion during the polymorphism period. This is the oldest fossil, the fossil is from the mid-Miocene era. As a result, the phylogenetic tree was obtained, the molecular evolution rate of the COI subfield was 0.63%/Myr, and the taxon's tendency was estimated to be にあると.さらに, に生じたdivergence of different places, について, genus of shellfish, horizontal direction 80-220 km/Myr, very high speed, dispersed, してきたと presumed された.・SNPs analysisによるHigh-resolution analysis of the differentiation process of な缝伝: について of the differentiation process of intraspecific の缝、the year before last Degree analysis and analysisっていたこともあり明らかになっていなかった.そこで, the current maximum number of individuals is too many, the distribution domain is horizontal, the vertical width is wide, the SNPs analysis is done, and the cluster structure is clear. Result of その, large きく3つの集団に分かれ, Asado no Kushiro・Erinsōchōji団とNortheast Chongji団はGeographic isolation によThe difference in water depth within the Tohoku Community and the difference in water depth within the Tohoku Community are the same as the differentiation of the left and right branches.このRESULTS からよりStrengthen な Discussion をするためには, Kushiro・Elouchi のThe water depth is 2000 m, pay close to のIndividual をANALYSIS に加えるNecessary がある.・KH-22-8 Nautical による新たなサンプル Collection: September 30th and October 17th issue The research ship "Hakuho Maru" is aboard the ship, and the E-sho Oki no Gradual Deep Sea Band is a super deep sea band (2000-8000 m) Participate in the survey of deep sea creatures. 4 kinds of 8 individual specimens of raw shellfish of the このnautical and チヂワバイ types were obtained. Special feature: "SNPs analysis is a high-resolution analysis of the differentiation process of the remaining specimens." It is a 2000 m specimen that is not enough. The acquisition and analysis of SNPs during the adoption extension period in fiscal year 2023 have been predetermined.