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Interactions for Bioinformatics Analysis

生物信息学分析的相互作用

基本信息

批准号：
20J22439
负责人：
末竹裕貴
金额：
$ 1.98万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-24 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本年度は、バイオインフォマティクス分野におけるデータ解析の再現性とユーザビリティを向上させることを目的として、Sapporoシステム、Yevisシステムと連携を強化し、および新たに開発したTonkazシステムの連携と機能拡張に注力しました。これらのシステムにより、ワークフローの効率的な実行や共有が実現され、更に、解析結果の再現性を自動評価するための新しい指標が提案されました。Tonkazシステムでは、リード数、マッピング率、変異頻度などの生物学的特徴値を用いて、結果の再現性を評価することを基本としています。実際の研究プロジェクトで使用されているワークフローやバイオインフォマティクス分野でよく遭遇するユースケースを用いた実験を通じて、提案された指標に基づく自動評価が可能であることを確認しました。Sapporo、Yevis、Tonkazの3つのシステムを実世界で運用し、それぞれの機能や性能を詳細に検証しました。その結果、バイオインフォマティクス分野における再現性の問題に対して、より緻密な評価が可能となり、再現性に関する議論の進展に寄与しました。また、これらのシステムに関する論文を執筆し、海外誌に投稿することで、国際的な研究コミュニティとの情報交換や共同研究の展開を試みました。本研究で開発したシステムや手法が、バイオインフォマティクス分野におけるデータ解析の再現性とユーザビリティの向上に貢献し、今後の研究活動やデータ解析の効率化に役立つことが期待されます。

This year, in recent years, in recent years, there have been significant changes in the overall performance of the industry. This year, in the current year, in recent years, in the current year, in the current year, in recent years, in the current year, in the current year, in recent years, in recent years, there has been a general analysis of the impact on the performance of the system. There is a common understanding of the detection, update, and analysis of the results of the monitoring system, which is responsible for the detection, update, and analysis of the results. The new information refers to the proposal of the new system. Tonkaz was used to determine the number of patients, the number of patients, the rate of infection, the specific use of biology, and the results showed that there was no significant difference between the two groups. The international research organization uses the information system to make sure that it is possible to make sure that the information is available. Sapporo, Yevis, Tonkazine 3 performance testing, performance monitoring, performance monitoring, performance The results, the results and the results. We will conduct joint research and launch joint research programs, such as the implementation of academic documents, overseas contributions, international research, and international research. The purpose of this study is to analyze the methods and methods of the study, and to analyze the differences between the two groups. In the future, the research activities will be analyzed and analyzed.