Analysis of the microbiome in intractable tropical skin diseases

顽固性热带皮肤病的微生物组分析

• 批准号: 20J40202
• 负责人: 村瀬 千晶
• 金额: $ 3.16万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-07-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20J40202/
• 关键词: 熱帯皮膚病; マイクロバイオーム; ブルーリ潰瘍; 16S rRNA解析

熱帯皮膚病において、皮膚マイクロバイオームが与える影響を解析することにより、宿主と微生物との相互作用の理解を通し、今後の臨床に広く貢献することを目指す。具体的な目的は以下のとおりである。①熱帯皮膚病の蔓延地域からの、検体輸送方法の確立。②熱帯皮膚病における微生物の構成や割合の解明。③培養が困難な微生物の可視化と熱帯皮膚病診断率の上昇。④抗生剤治療前後における皮膚マイクロバイオームの変化と、難治症例の評価。⑤増悪・重症化の予測因子の解明。具体的には、コートジボワールのブルーリ潰瘍の患者にて集団検診を利用し、抗生剤治療前後での病変部の皮膚細菌叢の変化を評価する。採取した検体は現地でDNA抽出後、名古屋大学にDNAを輸送し、微生物間で高度に保存されている領域を利用した16SrRNA解析を行う。細菌叢全体の遺伝子情報を解明することで、治療前後における細菌叢の構成の変化を解明する。一昨年度は、適切な検体採取と解析方法を確立するため、まずは健常皮膚やブルーリ潰瘍以外の皮膚疾患において皮膚マイクロバイオームの解析を行った。採取した皮膚常在菌の検体につき、様々なDNA抽出方法での条件検討を行いて、最も効率的に皮膚常在細菌叢のDNAが得られる条件検討を行った。昨年度も、得られたDNAを用いて、実際にMiSeqで16SrRNA解析を行い、個々の症例における菌叢解析の結果を集積した。また、現地スタッフの協力を得て、コートジボワールのブルーリ潰瘍患者5症例から、パイロットスタディ用の臨床検体を採取した。昨年度は、パイロットスタディで採取した臨床検体を名古屋大学に抽出DNAの形で輸送し、16SrRNA解析を行った。本年度は、コートジボワールのブルーリ潰瘍患者5症例の検体のdata解析を行った。

The skin disease, the skin, the skin, the skin and the skin. The following is the specific "purpose". 1. Make sure that the method of dermatosis and body transportation is established in the area where the disease is spreading. 2. The dermatosis, the microbes, the cutters, the cutters, the microbes, the microbes. (3) the cut-off rate of dermatosis is higher than that of microorganisms. (4) before and after the treatment of antibiotics, the skin should be treated, the skin should be treated and the symptoms should be treated. 5The severity of the disease was explained by the "factor". The specific symptoms of the disease were collected from the patients before and after the treatment of antibiotics and antibiotics. After the DNA was extracted, the Nagoya University DNA sent, the microorganism highly preserved, the field analyzed by 16SrRNA. The whole body of bacteria is in the mood for understanding and treatment. Before and after treatment, it is necessary to treat the bacteria into a solution. For the first time in the year, the analytical method is used to make sure that the skin is not affected by skin diseases other than the normal skin. The DNA extraction method, the condition, the line, and the highest rate of skin are often obtained in the bacteria, DNA, and so on. Last year, the results of DNA analysis, international MiSeq 16SrRNA analysis, and bacterial analysis of two cases of illness were collected. There were 5 patients with symptoms and symptoms, and the patients were treated with the bed and body. Last year, I asked you to pick up the bed, the Nagoya University, the DNA, the delivery, the 16SrRNA analysis. This year, the data analysis was performed in 5 patients with multiple symptoms.