Differences of microbiota and development of recovery methods from disbiosis of small mammals with different styles of coprophagy

本研究では食糞様式（①糞を肛門から直接に食べる、②落ちている糞を拾い食いする、③食糞をしない）に着目し、その腸内細菌叢の構成と、ディスバイオシスからの回復方法の構築を試みる。コロナ禍のため、これまでは野生由来バイオリソースを利用して、①および②の食糞を行う小型哺乳類をターゲットとした実験を実施してきた。2022年度はフィールド調査を再開し、③食糞をしない小型哺乳類を捕獲し、その腸内細菌叢を明らかにした。新規に捕獲した個体および過去に保存していたサンプルを材料として、コウベモグラ８個体、スンクス（ジャコウネズミ）7個体、ワタセジネズミ3個体、ヒミズ３個体、サドモグラ２個体、エチゴモグラ２個を用いた。これら食糞をしない小型哺乳類の腸内細菌叢は殆ど知られていないことから、採取できた消化管内容物について、上部消化管、下部消化管、胃といった部位毎に解析を行った。また対照群としてマウスの消化管内容物を用いた。その結果、これら6種の腸内細菌叢は全部位を通じてFirmicutes門とProteobacteria門が多数を占めた。興味深いことに、これら6種のうち４種ではBacteroidetes門が検出されず、Bacteroidetes門が検出されたサドモグラおよびスンクスでも、その割合は極めて少なかった。同条件下で実験を行ったICRマウスの腸内細菌叢にはBacteroidetes門が42.42%±3.98%検出された。従って、これら食糞をしない小型哺乳類の腸内細菌叢はFirmicutes門とProteobacteria門が優勢で、Bacteroidetes門が存在しない、もしくは極めて少ないという特徴を持つことが示された。

本研究では食糞様式（①糞を肛門から直接に食べる、②落ちている糞を拾い食いする、③食糞をしない）に着目し、その腸内細菌叢の構成と、ディスバイオシスからの回復方法の構築を試みる。コロナ禍のため、これまでは野生由来バイオリソースを利用して、①および②の食糞を行う小型哺乳類をターゲットとした実験を実施してきた。2022年度はフィールド調査を再開し、③食糞をしない小型哺乳類を捕獲し、その腸内細菌叢を明らかにした。新規に捕獲した個体および過去に保存していたサンプルを材料として、コウベモグラ８個体、スンクス（ジャコウネズミ）7個体、ワタセジネズミ3個体、ヒミズ３個体、サドモグラ２個体、エチゴモグラ２個を用いた。これら食糞をしない小型哺乳類の腸内細菌叢は殆ど知られていないことから、採取できた消化管内容物について、上部消化管、下部消化管、胃といった部位毎に解析を行った。また対照群としてマウスの消化管内容物を用いた。その結果、これら6種の腸内細菌叢は全部位を通じてFirmicutes門とProteobacteria門が多数を占めた。興味深いことに、これら6種のうち４種ではBacteroidetes門が検出されず、Bacteroidetes門が検出されたサドモグラおよびスンクスでも、その割合は極めて少なかった。同条件下で実験を行ったICRマウスの腸内細菌叢にはBacteroidetes門が42.42%±3.98%検出された。従って、これら食糞をしない小型哺乳類の腸内細菌叢はFirmicutes門とProteobacteria門が優勢で、Bacteroidetes門が存在しない、もしくは極めて少ないという特徴を持つことが示された。