非凍結結晶を用いた“in crystallo”酵素反応解析
非凍結結晶を用いた“in crystallo”酵素反応解析
批准号:
20K06530
负责人:
村川 武志
金额:
$2.75万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2024-03-31
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英文摘要
本研究は,HAG法(湿度調整と水溶性ポリマーのコーティングを用いたタンパク質結晶マウント法)を発展させ,温度やpHが正確に制御された環境下での結晶内の酵素反応を,X線結晶構造解析および結晶顕微分光により直接的に観察することを目的としている.研究試料として土壌細菌Arthrobacter globiformisに由来した銅アミン酸化酵素 (AGAO)を使用し,本酵素の補酵素であるトパキノン(TPQ)の生合成過程における,前駆体Tyr残基からTPQへの構造変化機構の解明を目指す.補酵素TPQは,酸素および銅イオン存在下で,前駆体Tyr残基から自己触媒的に生成する.このため,まず我々は銅イオン非存在下で,大腸菌内にてAGAOを発現,精製し,本酵素の前駆体(Tyr型)結晶を作成した.得られた結晶を嫌気条件下で銅イオン溶液に浸漬後,SPring-8のビームラインに設置されたHAG装置にマウントした.この結晶への吹付け気流を窒素から酸素(空気)に切り替えることにより,結晶内でのTPQ形成反応を開始した.気流切り替え後,経時的に回折測定を行い反応を追跡したところ,結晶内で最終的にTPQが形成したことを確認できた.回折実験に並行し,ビームラインに設置されたオンライン型結晶顕微分光装置による測定も行った.結晶の厚み,および反応の進行度とTPQに由来する480 nmの吸収に良い相関関係が得られ,回折と分光をリンクさせた測定が可能となった.現在,詳細な解析を行っているが,構造変化についての重要な知見が得られ,我々がこれまでに提案した反応スキームをさらに拡張できた.
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Molecular movie of the catalytic reaction of bacterial copper amine oxidase conducted by mix and inject serial femtosecond X ray crystallography
混合注射连续飞秒X射线晶体学观察细菌铜胺氧化酶催化反应的分子膜
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takeshi Murakawa , Mamoru Suzuki, Kenji Fukui, Tetuya Masuda, Ikuko Miyahara, Takehiko Tosha, Takato Yano, So Iwata, Eriko Nango, Katsuyuki Tanizawa, Toshihide Okajima]
通讯作者:
Toshihide Okajima
Microcrystal preparation for serial femtosecond X-ray crystallography of bacterial copper amine oxidase
细菌铜胺氧化酶连续飞秒X射线晶体学微晶制备
DOI:
10.1107/s2053230x21008967
发表时间:
2021
期刊:
Acta Crystallographica Section F Structural Biology Communications
影响因子:
--
作者:
[Murakawa Takeshi, Suzuki Mamoru, Arima Toshi, Sugahara Michihiro, Tanaka Tomoyuki, Tanaka Rie, Iwata So, Nango Eriko, Tono Kensuke, Hayashi Hideyuki, Fukui Kenji, Yano Takato, Tanizawa Katsuyuki, Okajima Toshihide]
通讯作者:
Okajima Toshihide
高分解能中性子結晶構造解析に基づく銅含有アミン酸化酵素の触媒機構
基于高分辨率中子晶体结构分析的含铜胺氧化酶催化机制
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yokosawa Takumi, Sato Aomi, Wakasugi Keisuke, 葛西卓磨, 村川武志]
通讯作者:
村川武志
DOI:
10.1107/s2059798322010385
发表时间:
2022-12-01
期刊:
ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-STRUCTURAL BIOLOGY
影响因子:
2.2
作者:
[Murakawa, Takeshi, Suzuki, Mamoru, Okajima, Toshihide]
通讯作者:
Okajima, Toshihide
二液混合シリアルフェムト秒X線結晶構造解析に基づく銅含有アミン酸化酵素触媒機構の解明 村川武志
基于两部分混合串行飞秒X射线晶体结构分析阐明含铜胺氧化酶的催化机制 Takeshi Murakawa
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[趙崑茘, 松永耕一, 水野広一, 王昊, 奥西勝秀, 泉哲郎, 村川武志]
通讯作者:
村川武志
共 8 条
量子論的観点に基づく酵素反応におけるプロトン移動の解析
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批准号:24K01687
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.9万
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财政年份:2024
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负责人:村川 武志
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依托单位:
速度論および熱力学的手法を用いた"in crystallo" 酵素反応解析
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批准号:23K18117
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2023
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负责人:村川 武志
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依托单位: