Investigating ligand-controlled GPCR activation mechanisms by cutting edge simulation

通过尖端模拟研究配体控制的 GPCR 激活机制

基本信息

  • 批准号：
    19H03191
  • 负责人：
    Kitao Akio
  • 金额：
    $ 11.07万
  • 依托单位：
    Tokyo Institute of Technology
  • 依托单位国家：
    日本
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 财政年份：
    2019
  • 资助国家：
    日本
  • 起止时间：
    2019-04-01 至 2023-03-31
  • 项目状态：
    已结题

项目摘要

项目成果

期刊论文数量（112）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
PaCS-MD/MSM : Parallel Cascade Selection Molecular Dynamic Simulation in Combination with Markov State Model as an Efficient non-Bias Sampling Method
PaCS-MD/MSM：并行级联选择分子动态模拟与马尔可夫状态模型相结合作为一种高效的无偏差采样方法
University of Tronto(カナダ)
多伦多大学（加拿大）
  • DOI：
  • 发表时间：
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
  • 通讯作者：
University of California, San Diego(米国)
加州大学圣地亚哥分校（美国）
  • DOI：
  • 发表时间：
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
  • 通讯作者：
Structure of MotA, a flagellar stator protein, from hyperthermophile
MotA（一种来自超嗜热生物的鞭毛定子蛋白）的结构
  • DOI：
    10.1016/j.bbrc.2022.09.072
  • 发表时间：
    2023
  • 期刊：
    Biochemical and Biophysical Research Communications
  • 影响因子：
    3.1
  • 作者：
    Tatsuro Nishikino;Norihiro Takekawa;Duy Phuoc Tran;Jun-ichi Kishikawa;Mika Hirose;Sakura Onoe;Seiji Kojima;Michio Homma;Akio Kitao;Takayuki Kato and Katsumi Imada
  • 通讯作者：
    Takayuki Kato and Katsumi Imada
Protein conformational change, association and dissociation observed using Fugaku and massively parallel molecular dynamics simulations
使用 Fugaku 和大规模并行分子动力学模拟观察蛋白质构象变化、缔合和解离
  • DOI：
  • 发表时间：
    2022
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    竹村和浩;北尾彰朗;Akio Kitao
  • 通讯作者：
    Akio Kitao
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Kitao Akio其他文献

Vibrational Energy Transfer from Heme through Atomic Contacts in Proteins
通过蛋白质中的原子接触从血红素进行振动能量转移
  • DOI：
    10.1021/acs.jpcb.8b03518
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    The Journal of Physical Chemistry B
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Yamashita Satoshi;Mizuno Misao;Tran Duy Phuoc;Dokainish Hisham;Kitao Akio;Mizutani Yasuhisa
  • 通讯作者：
    Mizutani Yasuhisa
油脂のおいしさと科学
油脂的美味与科学
  • DOI：
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
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    松村成暢
FTIR study of photoactivated cyclase
光活化环化酶的 FTIR 研究
  • DOI：
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Dokainish Hisham M.;Yamada Daichi;Iwata Tatsuya;Kandori Hideki;Kitao Akio;Daichi Yamada
  • 通讯作者：
    Daichi Yamada
災害状況を考慮したファイル伝送手法に関する一検討
考虑灾害情况的文件传输方法研究
  • DOI：
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Takemura Kazuhiro;Matubayasi Nobuyuki;Kitao Akio;江戸麻人，和泉諭，阿部亨，菅沼拓夫
  • 通讯作者：
    江戸麻人，和泉諭，阿部亨，菅沼拓夫
Similarities and Differences between Thymine(6?4)Thymine/Cytosine DNA Lesion Repairs by Photolyases
光解酶修复胸腺嘧啶 (6?4) 胸腺嘧啶/胞嘧啶 DNA 损伤的异同

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  • 作者：
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  • 通讯作者：
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Flexibility, interactions, and function control mechanisms in multi-domain proteins
多结构域蛋白质的灵活性、相互作用和功能控制机制
  • 批准号：
    15H04357
  • 财政年份：
    2015
  • 资助金额：
    $ 11.07万
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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