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大規模パターン解析と比較ゲノムで探る動物体表模様の局所的・大域的多様性と進化

利用大规模模式分析和比较基因组学探索动物体表模式的局部和全球多样性和进化

基本信息

批准号：
19H03283
负责人：
宮澤清太
金额：
$ 11.15万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19H03283/
关键词：
模様パターン

项目摘要

動物の体表には多彩な模様パターンが見られる。模様パターンの多様性は、個々の生物分類群に特有の「局所的多様性」と、系統をまたいだ複数の分類群に共通する「大域的多様性」という２つのレベルに分けることができると考えられる。本研究課題では、２つの多様性レベルとそれらに関わるパターン形成メカニズムの違いを踏まえながら、模様パターンの多様性が「なぜ、どのように」生み出されてきたのかを明らかにすることを目指している。本年度は、昨年度に引き続き、現生の魚類全科・全属の魚種を対象とした独自の大規模魚類模様パターンデータベースの構築および整備を進めた。さらに、これまでに蓄積してきた海産、淡水産を含む18,000種あまり、約4,000属の形質データをもとに、系統比較法(Phylogenetic comparative methods)の適用を試みた。本研究では魚類全体で頻出する11の模様パターンモチーフに着目しているが、系統比較法の適用にあたっては、モチーフ3つずつの組み合わせを取り上げ、それぞれのモチーフが独立に進化する独立モデルと、あるモチーフの進化（獲得・喪失）が他のモチーフの状態に依存して遷移する非独立モデル、さらに、3つのうち1つのモチーフのみ独立に獲得・喪失が生じる部分的独立モデルを考え、シミュレーションによる検討を行った。この結果、調査対象とした主要魚類10目中8目において、ある種の模様パターンモチーフ間の相関進化を示唆する結果が得られた。

The animal's body surface is colorful. The diversity of a model is different from that of a taxon. The diversity of a system is unique to a taxon. The diversity of a system is common to a taxon. The diversity of a system is common to a taxon. This research topic is about two kinds of diversity, namely, diversity, diversity. This year's fish population, including all species, has been improved. There are about 18,000 species of marine and freshwater products in the world, and about 4,000 species of marine and freshwater products are included in the world. The application of Phylogenetic comparative methods is tested. In this study, we found that fish populations frequently appeared in 11 different modes, and the application of systematic comparison method in different groups of fish populations was not independent of each other, but independent of each other. 3. The first step is to gain independence and lose independence. The second step is to discuss independence. The results showed that 8 out of 10 species of fish species were related to the evolution of fish species.

项目成果

期刊论文数量（15）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

魚類体表模様パターンへの系統比較法適用の試み

系统发育比较方法在鱼类体表模式中的尝试

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Shigeru Kondo;Masakatsu Watanabe;S. Miyazawa;Miyazawa Seita;Seita Miyazawa;宮澤清太;宮澤清太;宮澤清太
通讯作者：
宮澤清太

フグ科魚類の体表模様と種間交雑

河豚体表形态及种间杂交

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Shigeru Kondo;Masakatsu Watanabe;S. Miyazawa;Miyazawa Seita;Seita Miyazawa;宮澤清太
通讯作者：
宮澤清太

How fish got their complex color patterns

鱼是如何获得复杂的颜色图案的

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Shigeru Kondo;Masakatsu Watanabe;S. Miyazawa;Miyazawa Seita;Seita Miyazawa;宮澤清太;宮澤清太;宮澤清太;Seita Miyazawa
通讯作者：
Seita Miyazawa

モヨウフグ属魚類の模様と系統

河豚属鱼类的形态和谱系

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Shigeru Kondo;Masakatsu Watanabe;S. Miyazawa;Miyazawa Seita;Seita Miyazawa;宮澤清太;宮澤清太;宮澤清太;Seita Miyazawa;Miyazawa Seita;宮澤清太
通讯作者：
宮澤清太

Can "pattern blending" cause speciation through hybridization?

“模式混合”可以通过杂交引起物种形成吗？

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
Shigeru Kondo;Masakatsu Watanabe;S. Miyazawa;Miyazawa Seita;Seita Miyazawa
通讯作者：
Seita Miyazawa

DOI：
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作者：
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通讯作者：
安崎遼路，伊藤伸一，長尾大道，水牧仁一朗，岡田真人，赤井一郎