iPS発がんモデルとゲノム編集スクリーニングによる神経芽腫エピゲノム療法開発

使用 iPS 致癌模型和基因组编辑筛选开发神经母细胞瘤表观基因组疗法

• 批准号: 19H03625
• 负责人: 上條 岳彦
• 金额: $ 11.07万
• 依托单位: Research Institute for Clinical Oncology Saitama Cancer Center
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-01 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19H03625/
• 关键词: iPS; 神経芽腫; エピゲノム; ゲノム編集; NCC; neuroblastoma; transcriptome; ChIPseq; MYCN; polycomb

I-1.神経芽腫におけるヒストン修飾コードのChIPseq解析とメチローム解析神経芽腫細胞株を用いて、ChIPseq解析：MYCN, H3K4me3, H3K27AceをMACS2ソフトウェアで解析した。TSS周囲10kbのヒートマップ解析で、これらの３つの結合部位は高頻度に一致していることを明らかにした。H3K4me3結合の13000部位の約6割7000遺伝子にMYCN結合が認められ、神経芽腫においてMYCNが転写のマスターレギュレーターであることを示唆していた。この7000遺伝子の関与する経路をDAVIDソフトウェアを用いて解析すると、転写、翻訳、細胞周期に関る経路の存在が認められた。次に神経芽腫細胞株を用いて、ChIPseq解析：H3K27me3とポリコームPRC2のEZH2を行った。このピークコールはDANPOS2ソフトウェアを用いて行い、閾値設定をlog10q value>50にて解析した。結果はH3K27me3とポリコームPRC2のEZH2で共在遺伝子が高頻度に認められた。同NB細胞にてイルミナInfiniumアレイを用いたメチローム解析を行った。PRC2分子EZH2の低分子阻害剤EPZ-6437を用いたところ、ゲノムメチル化に与える影響は少ないことが判明した。さらにDNMT阻害剤をEZH2iと併用すると、相乗的な細胞増殖抑制効果が認められた。I-2. MYCN導入NCC形質転換クローンのトランスクリプトーム解析アジレントマイクロアレイによるトランスクリプトーム解析を野生型iPS:3例とp53変異患者由来iPS1例について行った。また同じく野生型iPSから誘導したNCC:3例とp53変異患者由来iPSから誘導したNCC1例のトランスクリプトーム解析を行った。さらに、これらを免疫不全マウスの副腎周囲脂肪織に移植し、得られた腫瘍のトランスクリプトーム解析を行った。

Imur1. MYCN, H3K4me3, H3K27Ace, MACS2, MYCN, H3K4me3, MACS2, cell line, cell line, cell line, In TSS, the height of the joint is the same as that of the TSS. The results show that there is no difference between the two parts. In the 13000 part of H3K4me3, there are about 6 times 7000 cuttings in the MYCN. The MYCN is used to show that the baby is instigated and instigated by the combination of the MYCN and the MYCN. "7000" and "DAVID" and "path" to analyze the existence of "reading", "writing", "flipping", "cell cycle" and "path". ChIPseq analysis: H3K27me3 cell strain was isolated from PRC2 cells by ChIPseq analysis. You need to set the log10q value>50 profile to parse the database with the DANPOS2 settings. Results the results showed that there was a high degree of H3K27me3 infection in all the children with high degree of PRC2 and EZH2. In the same way as NB, you can parse the row data in the same way that you want to parse the line. The PRC2 molecule EZH2 "low molecular weight blocking" EPZ-6437 is identified by the use of "low molecular weight", "low molecular weight", "low molecular weight" and "low molecular weight". The results showed that the colonization of DNMT was blocked by EZH2i, and the colonization was suppressed by the same method. Imura 2. The MYCN was introduced into the NCC form. The wild type iPS:3 case, the p53 case, the origin of the iPS1 patient, the wild type patient, the patient, and the patient. This is the same as that of wild-type iPS. This is the same as the case of NCC:3. The patient of p53 was diagnosed by iPS. The patient of NCC1 was diagnosed as NCC. The immune system is not complete, and the fat is not transplanted in the periphery.

项目成果

THE EVALUATION OF THE NEW GUIDELINE FOR ASSESSING IMAGE-DEFINED RISK FACTORS IN THE LOW-RISK PROTOCOL (JN-L-10) FROM THE JAPAN CHILDREN’S CANCER GROUP NEUROBLASTOMA COMMITTEE

日本儿童癌症组神经母细胞瘤委员会对低风险方案 (JN-L-10) 中影像定义风险因素评估新指南的评估

• 发表时间: 2019
• 作者: Yoneda A ;Iehara T;Yokota I;Takahashi H ;Teramukai S;Kamijo T;Nakazawa A Takimoto T;Kikuta A;Ikeda H;Nakagawara A ;Tajiri T;Japan Children’s Cancer Group (JCCG) Neuroblastoma Committee (JNBSG),
• 通讯作者: Japan Children’s Cancer Group (JCCG) Neuroblastoma Committee (JNBSG),

Combined Genetic and Chromosomal Characterization of Wilms Tumors Identifies Chromosome 12 Gain as a Potential New Marker Predicting a Favorable Outcome

• DOI: 10.1016/j.neo.2018.10.007
• 发表时间: 2019-01-01
• 期刊: NEOPLASIA
• 影响因子: 4.8
• 作者: Haruta, Masayuki;Arai, Yasuhito;Kaneko, Yasuhiko
• 通讯作者: Kaneko, Yasuhiko

Recycling endosomal CD133 functions as an inhibitor of autophagy at the pericentrosomal region

• DOI: 10.1038/s41598-019-39229-8
• 发表时间: 2019-02-19
• 期刊: SCIENTIFIC REPORTS
• 影响因子: 4.6
• 作者: Izumi, Hideki;Li, Yuanyuan;Nakagawara, Akira
• 通讯作者: Nakagawara, Akira

Miki Ohira, Hiroyuki Shichino, Takashi Kubo, Masayuki Haruta, Tetsuya Takimoto, Atsuko Nakazawa, Fumito Yamazaki, Hiroki Nagase, Tatsuro Tajiri, Akira Nakagawara , Hitoshi Ichikawa, Tomoro Hishiki, Takehiko Kamijo, Japan Children’s Cancer Group (JCCG) Neu

Miki Ohira、Hiroyuki Shichino、Takashi Kubo、Masayuki Haruta、Tetsuya Takimoto、Atsuko Nakazawa、Fumito Yamazaki、Hiroki Nagase、Tatsuro Tajiri、Akira Nakakawara、Hitoshi Ichikawa、Tomoro Hishiki、Takehiko Kamijo、日本儿童癌症小组 (JCCG) Neu

• 发表时间: 2019
• 作者: Tan NB;Pagnamenta AT;others;Matsumoto N;Miyake N;Sheffer R;Mor-Shaked H;Barnett CP;Byrne AB;Scott HS;Kraus A;Cappuccio G;Brunetti-Pierri N;Iorio R;Di Dato F;Pais LS;Yeung A;Tan TY;Taylor JC;Christodoulou J;White SM.;Toward genome medicine for pediatric cancer: Genomic characterization of high-risk neuroblastoma by cancer gene panel tests.
• 通讯作者: Toward genome medicine for pediatric cancer: Genomic characterization of high-risk neuroblastoma by cancer gene panel tests.

A Polymorphic Variant in p19Arf Confers Resistance to Chemically Induced Skin Tumors by Activating the p53 Pathway

p19Arf 的多态性变体通过激活 p53 途径赋予对化学诱导的皮肤肿瘤的抵抗力

• DOI: 10.1016/j.jid.2018.12.027
• 发表时间: 2019
• 期刊: Journal of Investigative Dermatology
• 影响因子: 6.5
• 作者: Saito M;Okumura K;Isogai E;Araki K;Tanikawa C;Matsuda K;Kamijo T;Kominami R;Wakabayashi Y.
• 通讯作者: Wakabayashi Y.