iPS発がんモデルとゲノム編集スクリーニングによる神経芽腫エピゲノム療法開発
iPS発がんモデルとゲノム編集スクリーニングによる神経芽腫エピゲノム療法開発
批准号:
19H03625
负责人:
上條 岳彦
金额:
$11.07万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-04-01 至 2023-03-31
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I-1.神経芽腫におけるヒストン修飾コードのChIPseq解析とメチローム解析神経芽腫細胞株を用いて、ChIPseq解析:MYCN, H3K4me3, H3K27AceをMACS2ソフトウェアで解析した。TSS周囲10kbのヒートマップ解析で、これらの3つの結合部位は高頻度に一致していることを明らかにした。H3K4me3結合の13000部位の約6割7000遺伝子にMYCN結合が認められ、神経芽腫においてMYCNが転写のマスターレギュレーターであることを示唆していた。この7000遺伝子の関与する経路をDAVIDソフトウェアを用いて解析すると、転写、翻訳、細胞周期に関る経路の存在が認められた。次に神経芽腫細胞株を用いて、ChIPseq解析:H3K27me3とポリコームPRC2のEZH2を行った。このピークコールはDANPOS2ソフトウェアを用いて行い、閾値設定をlog10q value>50にて解析した。結果はH3K27me3とポリコームPRC2のEZH2で共在遺伝子が高頻度に認められた。同NB細胞にてイルミナInfiniumアレイを用いたメチローム解析を行った。PRC2分子EZH2の低分子阻害剤EPZ-6437を用いたところ、ゲノムメチル化に与える影響は少ないことが判明した。さらにDNMT阻害剤をEZH2iと併用すると、相乗的な細胞増殖抑制効果が認められた。I-2. MYCN導入NCC形質転換クローンのトランスクリプトーム解析アジレントマイクロアレイによるトランスクリプトーム解析を野生型iPS:3例とp53変異患者由来iPS1例について行った。また同じく野生型iPSから誘導したNCC:3例とp53変異患者由来iPSから誘導したNCC1例のトランスクリプトーム解析を行った。さらに、これらを免疫不全マウスの副腎周囲脂肪織に移植し、得られた腫瘍のトランスクリプトーム解析を行った。
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THE EVALUATION OF THE NEW GUIDELINE FOR ASSESSING IMAGE-DEFINED RISK FACTORS IN THE LOW-RISK PROTOCOL (JN-L-10) FROM THE JAPAN CHILDREN’S CANCER GROUP NEUROBLASTOMA COMMITTEE
日本儿童癌症组神经母细胞瘤委员会对低风险方案 (JN-L-10) 中影像定义风险因素评估新指南的评估
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yoneda A , Iehara T, Yokota I, Takahashi H , Teramukai S, Kamijo T, Nakazawa A Takimoto T, Kikuta A, Ikeda H, Nakagawara A , Tajiri T, Japan Children’s Cancer Group (JCCG) Neuroblastoma Committee (JNBSG),]
通讯作者:
Japan Children’s Cancer Group (JCCG) Neuroblastoma Committee (JNBSG),
DOI:
10.1016/j.neo.2018.10.007
发表时间:
2019-01-01
期刊:
NEOPLASIA
影响因子:
4.8
作者:
[Haruta, Masayuki, Arai, Yasuhito, Kaneko, Yasuhiko]
通讯作者:
Kaneko, Yasuhiko
Miki Ohira, Hiroyuki Shichino, Takashi Kubo, Masayuki Haruta, Tetsuya Takimoto, Atsuko Nakazawa, Fumito Yamazaki, Hiroki Nagase, Tatsuro Tajiri, Akira Nakagawara , Hitoshi Ichikawa, Tomoro Hishiki, Takehiko Kamijo, Japan Children’s Cancer Group (JCCG) Neu
Miki Ohira、Hiroyuki Shichino、Takashi Kubo、Masayuki Haruta、Tetsuya Takimoto、Atsuko Nakazawa、Fumito Yamazaki、Hiroki Nagase、Tatsuro Tajiri、Akira Nakakawara、Hitoshi Ichikawa、Tomoro Hishiki、Takehiko Kamijo、日本儿童癌症小组 (JCCG) Neu
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tan NB, Pagnamenta AT, others, Matsumoto N, Miyake N, Sheffer R, Mor-Shaked H, Barnett CP, Byrne AB, Scott HS, Kraus A, Cappuccio G, Brunetti-Pierri N, Iorio R, Di Dato F, Pais LS, Yeung A, Tan TY, Taylor JC, Christodoulou J, White SM., Toward genome medicine for pediatric cancer: Genomic characterization of high-risk neuroblastoma by cancer gene panel tests.]
通讯作者:
Toward genome medicine for pediatric cancer: Genomic characterization of high-risk neuroblastoma by cancer gene panel tests.
DOI:
10.1038/s41598-019-39229-8
发表时间:
2019-02-19
期刊:
SCIENTIFIC REPORTS
影响因子:
4.6
作者:
[Izumi, Hideki, Li, Yuanyuan, Nakagawara, Akira]
通讯作者:
Nakagawara, Akira
A Polymorphic Variant in p19Arf Confers Resistance to Chemically Induced Skin Tumors by Activating the p53 Pathway
p19Arf 的多态性变体通过激活 p53 途径赋予对化学诱导的皮肤肿瘤的抵抗力
DOI:
10.1016/j.jid.2018.12.027
发表时间:
2019
期刊:
Journal of Investigative Dermatology
影响因子:
6.5
作者:
[Saito M, Okumura K, Isogai E, Araki K, Tanikawa C, Matsuda K, Kamijo T, Kominami R, Wakabayashi Y.]
通讯作者:
Wakabayashi Y.
共 8 条
iPS/NCC神経芽腫モデルによるスーパーエンハンサー形成の時空間解析と応用
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批准号:24K10991
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2024
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负责人:上條 岳彦
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依托单位:
乳児突然死をきたすミトコンドリア脂肪酸β酸化酵素欠損症の遺伝子解析
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批准号:07770567
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1995
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负责人:上條 岳彦
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依托单位:
海外基金