Elucidation of colonization processes of insect-soil-plant environments in Burkholderia species
阐明伯克霍尔德氏菌在昆虫-土壤-植物环境中的定植过程
基本信息
- 批准号:19J01106
- 负责人:
- 金额:$ 3.08万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2019
- 资助国家:日本
- 起止时间:2019-04-25 至 2022-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Burkholderia属細菌は、土壌、カメムシ腸内、植物根圏といった多様な自然環境に生息していることが知られており、カメムシ腸内に共生するBurkholderia属細菌も、環境中では土壌や植物に定着している可能性がある。そこで本研究では、 ゲノムワイドスクリーニング手法の一つであるTn-seqを用いて、Burkholderia insecticolaのカメムシ腸内・土壌・ダイズ根圏への定着に必要な遺伝子を網羅的に探索し、昆虫・土壌・植物への定着機構を広範に比較することで、Burkholderia属細菌の昆虫腸内への定着機構をより鮮明に描き出すことを目的としている。研究2年目にあたる本年度は、(1)土壌およびダイズ根圏におけるB.insecticolaのTn-seq解析、(2)標的遺伝子変異株の作製とその機能評価を行った。(1)に関して、前年度に実施した次世代シーケンス解析データをPyythonプログラム"TRANSIT"を用いて、B. insecticolaの土壌およびダイズ根圏への定着に関わる遺伝子を探索した。その結果、B. insecticolaはエネルギー生成、ストレス耐性、アミノ酸の生合成に関連する遺伝子が土壌中への定着に必要であることが明らかになった。その一方、ダイズ根圏では、B.insecticolaの抗菌ペプチド耐性や有機酸の資化に関わる遺伝子が必要であり、ダイズ根の分泌物の影響を受けていることが示唆された。本研究成果は原著論文にまとめている。(2)に関して、プラスミド挿入型の標的遺伝子変異株をホソヘリカメムシに感染させると、変異株は消化管内で野生型に復帰してしまう現象が確認された。そこで、プラスミド挿入変異株から相同組換えを用いた標的遺伝子欠損株に変更し、カメムシ腸内・土壌・ダイズ根圏への定着に関わる候補遺伝子に対して、欠損株の作製を進めている。
Burkholderia bacteria live in the gut, plant root system and multiple natural environments. It is possible for Burkholderia bacteria to live in the gut, plant root system and multiple natural environments. In this study, we explored the application of Burkholderia insecticidal ola in the study of intestinal fixation of insect, soil and plant. We compared the model of fixation mechanism of Burkholderia bacteria in the study. This year, we conducted research on: (1) root system analysis of B. infestola;(2) production and functional evaluation of target mutants. (1)In the previous year, the next generation was implemented, and the next generation was analyzed. Insecticiola's soil and soil are the root of the problem. The results of B. Insecticiola is a natural organism that is essential to the development of a plant, its ability to tolerate and react to acid production. B. Insecticiola is resistant to antibiotics and organic acids. It is necessary for insects to be affected by their secretions. The results of this study are contrary to the original paper. (2)In addition, it was confirmed that the wild-type mutant strain was infected with the wild-type mutant strain in the digestive tract. In addition, the selection of candidate genes for the selection of different plants from the same group, the selection of target genes for the selection of defective plants, the selection of candidate genes for the selection of defective plants from the same group, and the selection of candidate genes for the selection of defective plants.
项目成果
期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Host-symbiont specificity in insects: Underpinning mechanisms and evolution
昆虫宿主共生体特异性:基础机制和进化
- DOI:10.1016/bs.aiip.2020.03.002
- 发表时间:2020
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Ohbayashi Tsubasa;Mergaert Peter;Kikuchi Yoshitomo
- 通讯作者:Kikuchi Yoshitomo
Dual oxidase enables insect gut symbiosis by mediating respiratory network formation
- DOI:10.1073/pnas.2020922118
- 发表时间:2021-03-09
- 期刊:
- 影响因子:11.1
- 作者:Jang, Seonghan;Mergaert, Peter;Kikuchi, Yoshitomo
- 通讯作者:Kikuchi, Yoshitomo
Genome-wide screening of essential genes for the bean bug midgut colonization in the Burkholderia symbiont
全基因组筛选豆臭虫中肠在伯克霍尔德氏菌共生体中定殖的必需基因
- DOI:
- 发表时间:2020
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Tsubasa Ohbayashi;Joy Lachat;Seonghan Jang;Raynald Cossard;Quentin Nicoud;Yoshitomo Kikuchi;Peter Mergaert
- 通讯作者:Peter Mergaert
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
大林 翼其他文献
The bean bug Riptortus pedestris and its Burkholderia symbiont
豆角虫 Riptortus pedestris 及其伯克霍尔德杆菌共生体
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
石神 広太;Seonghan Jang;伊藤 英臣;大林 翼;Peter Mergaert;菊池 義智;菊池義智;菊池 義智;菊池 義智;菊池 義智 - 通讯作者:
菊池 義智
昆虫腸内共生の成立機構
昆虫肠道共生的建立机制
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
石神 広太;Seonghan Jang;伊藤 英臣;大林 翼;Peter Mergaert;菊池 義智;菊池義智 - 通讯作者:
菊池義智
ホソヘリカメムシ盲嚢特異的“システインリッチタンパク質”の機能解析
椿象盲肠特有的富含半胱氨酸的蛋白质的功能分析
- DOI:
- 发表时间:
2015 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
大林 翼;Peter Mergaert;二橋 亮;鎌形 洋一;深津 武馬;菊池 義智 - 通讯作者:
菊池 義智
菌食う虫も好き好き:ホソヘリカメムシへ特異的に共生する細菌の謎
吃细菌的臭虫也很挑剔:与臭虫特异性共存的细菌之谜
- DOI:
- 发表时间:
2014 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
大林 翼;竹下 和貴;菊池 義智 - 通讯作者:
菊池 義智
カびが繋ぐ昆虫とバクテリアの共生系サイクル
通过霉菌连接昆虫和细菌的共生循环
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
石神 広太;Seonghan Jang;伊藤 英臣;大林 翼;Peter Mergaert;菊池 義智 - 通讯作者:
菊池 義智
大林 翼的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('大林 翼', 18)}}的其他基金
農耕地土壌で優占する未知のアンモニア酸化細菌の分離培養とその機能解析
农业土壤中优势未知氨氧化细菌的分离培养及其功能分析
- 批准号:
24K17809 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
ホソヘリカメムシ共生器官で特異的に発現する遺伝子群の網羅的機能解析
椿象共生器官特异表达基因的综合功能分析
- 批准号:
14J03996 - 财政年份:2014
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
相似国自然基金
基于Tn-Seq技术的阪崎克罗诺杆菌耐胆盐分子机制研究
- 批准号:31772084
- 批准年份:2017
- 资助金额:60.0 万元
- 项目类别:面上项目
利用转座子随机插入文库测序(Tn-Seq)的方法研究霍乱弧菌的耐盐机制并鉴定耐盐相关基因
- 批准号:81702055
- 批准年份:2017
- 资助金额:20.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
相似海外基金
Tn-seq analysis of Legionella pathogenicity
军团菌致病性的TN-seq分析
- 批准号:
19H03470 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Genome-wide search for genes of Type IX secretion system by effective Tn-Seq analysis
通过有效的 Tn-Seq 分析对 IX 型分泌系统的基因进行全基因组搜索
- 批准号:
17H04370 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Determination of Porphyromonas antimicrobial resistance mechanisms by Tn-Seq
通过 Tn-Seq 确定卟啉单胞菌耐药机制
- 批准号:
8628666 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Determination of Porphyromonas antimicrobial resistance mechanisms by Tn-Seq
通过 Tn-Seq 确定卟啉单胞菌耐药机制
- 批准号:
8448367 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Determination of Porphyromonas antimicrobial resistance mechanisms by Tn-Seq
通过 Tn-Seq 确定卟啉单胞菌耐药机制
- 批准号:
8317158 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别: