课题基金 / 基金详情

small RNA analysis using near-isogenic line related to resistance to Rice Tungro disease

small RNA analysis using near-isogenic line related to resistance to Rice Tungro disease
使用与水稻东格罗病抗性相关的近等基因系进行小 RNA 分析
批准号:
19J11369
负责人:
齋藤 希
金额:
$1.09万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-04-25 至 2021-03-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
本研究は、イネツングロ病の原因となるDNAウイルス、イネツングロバシリフォームウイルス(RTBV)に抵抗性のある準同質遺伝子系統(TW16)を用いて、RTBV抵抗性にsmall RNA(sRNA)が関与する可能性を調べ、その因子の特定を進めることを目的とした。イネツングロ病は、現在に至るまで南アジアや東南アジアにおいて稲の減収の原因となっており、時に経済に大きな損害を与える。当該年度は、感染試験とsRNA解析によりRTBV抵抗性や感染時に強く関連するsRNAおよびmicro RNA(miRNA)を見出した。【1.感染試験】RTBV感受性を示す1品種およびRTBV抵抗性を持つTW16を含む2系統に対しRTBV接種試験を行い、草丈の矮化と葉の黄変の病徴に関して明らかな差異を確認した。また、感受性品種は収量やバイオマスが大きく減少したが、RTBV抵抗性をもつ2系統はRTBVに感染した際にも重要農業形質に影響はなかった。特にRTBV抵抗性準同質遺伝子系統であるTW16は抵抗性育種に有用な系統であることが明らかとなった。また、感染後10日が経過した個体の葉をサンプリングし、small RNA解析に使用した。【2.sRNA発現解析】sRNA-seqにより、両者で大きく発現が異なるウイルス由来siRNAおよびイネ内在性miRNAを見出した。さらに、Argonaute遺伝子の経時的な発現解析により、感染初期におけるウイルスに対抗するRNAサイレンシング関連遺伝子(AGO1b、AGO2)の発現上昇が抵抗性を付与しているのではないかと示唆された。本研究において抵抗性系統TW16がRTBV感染の影響を受けても有用な農業形質を損なわないこと、また抵抗性関連small RNAsを見出したことはRTBVに対する抵抗性育種研究にとって有用な成果であるといえる。
英文摘要
本研究は、イネツングロ病の原因となるDNAウイルス、イネツングロバシリフォームウイルス(RTBV)に抵抗性のある準同質遺伝子系統(TW16)を用いて、RTBV抵抗性にsmall RNA(sRNA)が関与する可能性を調べ、その因子の特定を進めることを目的とした。イネツングロ病は、現在に至るまで南アジアや東南アジアにおいて稲の減収の原因となっており、時に経済に大きな損害を与える。当該年度は、感染試験とsRNA解析によりRTBV抵抗性や感染時に強く関連するsRNAおよびmicro RNA(miRNA)を見出した。【1.感染試験】RTBV感受性を示す1品種およびRTBV抵抗性を持つTW16を含む2系統に対しRTBV接種試験を行い、草丈の矮化と葉の黄変の病徴に関して明らかな差異を確認した。また、感受性品種は収量やバイオマスが大きく減少したが、RTBV抵抗性をもつ2系統はRTBVに感染した際にも重要農業形質に影響はなかった。特にRTBV抵抗性準同質遺伝子系統であるTW16は抵抗性育種に有用な系統であることが明らかとなった。また、感染後10日が経過した個体の葉をサンプリングし、small RNA解析に使用した。【2.sRNA発現解析】sRNA-seqにより、両者で大きく発現が異なるウイルス由来siRNAおよびイネ内在性miRNAを見出した。さらに、Argonaute遺伝子の経時的な発現解析により、感染初期におけるウイルスに対抗するRNAサイレンシング関連遺伝子(AGO1b、AGO2)の発現上昇が抵抗性を付与しているのではないかと示唆された。本研究において抵抗性系統TW16がRTBV感染の影響を受けても有用な農業形質を損なわないこと、また抵抗性関連small RNAsを見出したことはRTBVに対する抵抗性育種研究にとって有用な成果であるといえる。
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
農学の多様なキャリアパス~農学と育種学のこれからを考える36
农业领域多样化的职业道路 - 思考农业和育种的未来 36
DOI: --
发表时间: 2020
期刊: 育種学研究
影响因子: --
作者: [Koichi Yamamori, Erina Yanagi, Nozomi Saito, Risa Sakamoto, Hiroki Matsuo, Hidetoshi Goto, Daisuke Tsugama, Hiromi Kanegae]
通讯作者: Hiromi Kanegae
Endogenous virus sequences provide an evidence for chromosomal region-specific evolution in Oryza AA-genome species.
内源病毒序列为水稻 AA 基因组物种的染色体区域特异性进化提供了证据。
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [Nozomi Saito, Chen Sunlu, Kanae Yamada, Il-Ryong Choi, Yohei Koide, Yuji Kishima]
通讯作者: Yuji Kishima
内在性ウイルス配列を指標としたOryza-AAゲノム種の染色体領域特異的な小進化
使用内源病毒序列作为指标的 Oryza-AA 基因组物种的染色体区域特异性微进化
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [齋籐希, 陳孫禄, 山田加奈恵, 小出陽平, Il-Ryong Choi, 貴島祐治]
通讯作者: 貴島祐治
遺伝子可視化教室の開催及び補助教材の作成・公開
  • 批准号:
    17H00203
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
  • 资助金额:
    $0.26万
  • 财政年份:
    2017
  • 负责人:
    齋藤 希
  • 依托单位:
国内基金
海外基金
ELOVL6通过NR2F1棕榈酰化驱动去势抵抗性前列腺癌交叉耐药的机制研究
  • 批准号:
    JCZRLH202600929
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2026
  • 负责人:
  • 依托单位:
抑制GLRX2协同雄激素疗法治疗去势抵抗性前列腺癌的机制研究
去势抵抗性前列腺癌新型表观遗传调控机制及靶向药物设计研究
基于溶瘤病毒M1载体的免疫唤醒新策略 治疗去势抵抗性前列腺癌的研究
  • 批准号:
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    10.0万元
  • 批准年份:
    2025
  • 负责人:
    胡成
  • 依托单位: