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多階層レベルのウイルス進化動態を解明する定量的研究

阐明多层次病毒进化动力学的定量研究

基本信息

批准号：
19J12155
负责人：
伊藤悠介
金额：
$ 1.47万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-25 至 2021-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19J12155/
关键词：
ウイルス数理 in slico 多階層進化数理モデル in slicoシミュレーション

项目摘要

申請者はこれまでに、分子-細胞-個体という多階層レベルでウイルス進化を実験科学と数理科学を用いて定量的に理解する研究課題を遂行してきた。生物物理学分野において、本研究課題は非常に重要視されてきた。ここで今年度は新型コロナウイルス感染症流行(COVID-19)の影響もあり、申請者は COVID-19 関連研究にも取り組み国立感染研究所との共同研究に参画し、治療薬に関する研究成果に貢献してきた。例えば、iScienceとFrontiers in Microbiologyより、共著論文が出版された。その他の研究業績として、理論生物学分野のトップジャーナルである Journal of Theoretical Biology 誌からも共著論文を 1 報出版された。学会発表については、昨年より実施していた公益財団法人がん研究会との共同研究で、本研究課題と類似の薬剤耐性下のがん進化に関する口頭発表を実施した。さらに COVID-19 に関連して、国内でも N501Y や E484K が報告されているように、変異株出現などのウイルス進化を理解することは重要であるという観点から、申請者は COVID-19 のウイルス進化に関わる研究も実施してきた。具体的には、変異を獲得するウイルスは日々体内でどの程度賛成されるのか?を明らかにするという目的のもと、in slico 実験を実施した。この結果、変異を 1 つ獲得したウイルスは日々産生されていることが示唆された。また、たとえ治療薬投与下であっても、変異ウイルスが出現するという可能性も示唆された。今後もこのようなシミュレーションを用いて詳細を明らかにすることができれば、COVID-19 での変異ウイルス/薬剤耐性ウイルス出現のメカニズムに貢献できると期待される。最後に、本制度を通じた多くの研究成果が功を奏して、申請者は今年度 2021 年 3 月に博士(理学)を取得することができた。そして、幸いにも民間研究所の研究職(常勤)に採用され、本研究課題に関連する研究事業にも従事していく予定である。

Applicants are pursuing research topics on molecular, cell-individual, multi-level, and quantitative understanding of evolutionary science and mathematical science. Biophysics is divided into two fields, and this research topic is very important. This year, the applicant contributed to the research results of the COVID-19 association research group and the National Institute of Infection Research. For example, iScience Frontiers in Microbiology, co-authored papers published. The Journal of Theoretical Biology published a paper on his research achievements. The research topic of this study is related to the oral expression of evolution under similar conditions. In addition, it is important to understand the relationship between COVID-19 and domestic N501Y and E484K, and to understand the evolution of COVID-19 in China. The specific, different, and different degrees of approval in the body. The purpose of the game is to make sure that the game is played. The result of this is that the difference is 1. The possibility of treatment is not obvious. In the future, we will discuss in detail the contribution of COVID-19 to the development of new technologies and technologies. Finally, the system has been approved and many research results have been reported. The applicant has obtained a doctor's degree in March 2021. Fortunately, the research position of the private research institute is adopted, and the research career related to this research topic is determined.