リボソームの翻訳一時停止現象がタンパク質合成に与える役割の解明

阐明核糖体翻译暂停现象对蛋白质合成的作用

基本信息

  • 批准号:
    19J14480
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.34万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2019
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2019-04-25 至 2021-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

リボソームの翻訳一時停止がタンパク質合成にどのような影響を与えているか解明することを目的として研究を行った。まず、どの遺伝子のどのコドンで翻訳一時停止が生じているか、網羅的に特定するため、複数のリボソームプロファイリング法を組み合わせて、大腸菌遺伝子で生じる翻訳一時停止の特定を試みたところ、125箇所の強固な翻訳一時停止位置を特定することに成功した。また、翻訳停止リボソームに蓄積したペプチジル-tRNAを生化学的に検出するintegrated nascent chain profiling(iNP)から推定される翻訳一時停止位置と今回特定した一時停止部位は強い相関関係にあることがわかった。次に特定した翻訳一時停止群の中のycbZに着目して実験を行った。Asn586でのリボソームの翻訳一時停止を生化学的レポーターアッセイ、tRNAシーケンス(tRNA-Seq)、およびクライオ電子顕微鏡(cryo-EM)によって検証したところ、実際に翻訳一時停止が生じていることが確認された。これらの結果は、大腸菌のリボソーム翻訳一時停止位置情報として有用なリソースを提供したと言える。
The purpose of the study is to improve the quality of the product. The method of combining the two methods was successful. The method of combining the two methods was successful. The method of combining the two methods was successful. The method of combining the two methods was successful. The accumulation of DNA and tRNA in a biochemical assay results in an integrated nascent chain profiling (iNP), which is presumed to be a strong correlation between the site where DNA is stored and the site where it is stored. The next time you turn around, you stop looking at the group. Asn586 is the first time that the system has been turned off. It is the first time that the system has been turned off. It is the first time that the system has been turned off. It is the second time that the system has been turned off. It is the first time that the system has been turned off. It is the second time that the system has been turned off. It is the first time that the system has been turned off. The results of this study are as follows: Coliform bacteria are isolated from the soil, and the information on the location of the bacteria is available.

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The Pentatricopeptide Repeat Protein PGR3 Is Required for the Translation of petL and ndhG by Binding Their 5′ UTRs
  • DOI:
    10.1093/pcp/pcaa180
  • 发表时间:
    2021-01-13
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Higashi, Haruka;Kato, Yoshinobu;Shikanai, Toshiharu
  • 通讯作者:
    Shikanai, Toshiharu
The landscape of ribosome elongation states revealed by footprint extension in bacteria
细菌足迹延伸揭示核糖体延伸状态的景观
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Fujita;T.;Yokoyama;T.;Taguchi;H.;Ito;T.;and Iwasaki;S.
  • 通讯作者:
    S.
Genome-wide bacterial ribosome conformation dynamics probed by ribosome profiling
通过核糖体分析探测全基因组细菌核糖体构象动力学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Fujita;T.;Yokoyama;T.;Chadani;Y.;Taguchi;H.;Ito;T.;and Iwasaki;S.
  • 通讯作者:
    S.
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    藤田 智也

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