Understanding the molecular mechanisms underlying recognition of ubiquitin signals by UBA domain containing proteins

了解含有 UBA 结构域的蛋白质识别泛素信号的分子机制

• 批准号: 33851618
• 负责人: Shahri Raasi, Ph.D.
• 金额: --
• 依托单位: Fachbereich Biologie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2005-12-31 至 2007-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/33851618?language=en
• 关键词: Understanding; molecular; mechanisms; underlying; recognition

Die sog. Ubiquitin-assoziierte (UBA) Domäne ist eine relativ kleine, unabhängig gefaltete Proteindomäne, die eine spezifische Bindung an Ubiquitin vermittelt und in Proteinen vorzufinden ist, welche in Ubiquitin-abhängige zelluläre Prozesse involviert sind. Strukturanalysen haben gezeigt, dass die UBA-Domäne durch ein kompaktes Bündel bestehend aus drei Helices mit einem definierten hydrophoben Oberflächenanteil charakterisiert ist, das für die Interaktion mit Ubiquitin erforderlich ist. Trotz ihrer strukturellen Ähnlichkeit unterscheiden sich verschiedene UBA-Domänen auf Aminosäureebene in ihrer jeweiligen Interaktion mit Ubiquitin, weshalb unterschiedliche UBA-Domänen unterschiedliche Bindungsaffinitäten für Ubiquitin aufweisen. Allgemein binden UBA-Domänen aber stärker an Polyubiquitinketten als an Monoubiquitin. Die Polyubiquitin-bindenden Eigenschaften von UBA-Domänen sind in der Evolution konserviert, wobei UBA-Domänen möglicherweise nicht nur als Ubiquitin-Rezeptoren agieren, sondern auch regulatorische Effekte auf die Funktion ihrer jeweiligen (ubiquitylierten) Zielproteine ausüben. In diesem Antrag werden verschiedene Methoden der Hefe-Genetik, Molekularbiologie, Biochemie und Biophysik angewandt, um die funktionelle Rolle von UBA-Domänen bei der Ubiquitin-vermittelten Regulation zellulärer Prozesse aufzuklären.

死sog。Ubiquitin-assozierte（乌巴）Domäne is eine relativ kleine，unabhängig gefaltete Proteindomäne，die eine speziophe he Bindung an Ubiquitin vermittelt and in Proteinen vorzufinden ist，welche in Ubiquitin-abhängige zelluläre Prozesse involviert sind.结构分析表明，UBA-Domäne通过一个由三个螺旋组成的具有明确疏水性的Oberflächenanteil特征的复合Bündel结构，与Ubiquitin相互作用。Trotz irer strukturellen Ähnlichkeit unterscheiden sich verschiedene UBA-Domänen auf Aminosäureebene in irrer jeweiligen Interaktion mit Ubiquitin，weshalb unterschiedliche UBA-Domänen unterschiedliche Bindungsaffinitäten für Ubiquitin aufweisen。所有结合UBA-Domänen的方法都是使用Polyubiquitinketten和Monubiquitin。UBA-Domänen的多聚泛素结合特征是进化的产物，UBA-Domänen的多聚泛素结合不仅仅是对泛素-受体的作用，还对它们的功能有调节作用。在这套韦尔登的Hefe-Genetik、分子生物学、生物化学和生物物理学方法中，UBA在Ubiquitin-vermittelten Regulation中的功能作用使其更快地进行。