Improving Coarse-Grained Molecular Models through the Combination of All-Atom Models and Machine Learning Methods

通过全原子模型和机器学习方法的结合改进粗粒度分子模型

基本信息

  • 批准号:
    19K06535
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.75万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2019
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2019-04-01 至 2023-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Efficient Conformational Sampling with an Adaptive Coarse-Grained Elastic Network Model using Dynamic Cross-Correlation Coefficient
使用动态互相关系数的自适应粗粒度弹性网络模型的高效构象采样
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ryo Kanada;Kei Terayama;Atsushi Tokuhisa;Shigeyuki Matsumoto;Yasushi Okuno
  • 通讯作者:
    Yasushi Okuno
A Heart simulator coupling the molecular dynamics with the finite element model: Cross-scale integration of our knowledge on heart
将分子动力学与有限元模型耦合的心脏模拟器:心脏知识的跨尺度整合
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Seiryo Sugiura;Ryo Kanada;Takumi Washio;Xiaoke Cui;Jun-ichi Okada;Yasushi Okuno;Toshiaki Hisada
  • 通讯作者:
    Toshiaki Hisada
Cross-linking of UT-Heart simulator and coarse-grained molecular simulation
UT-Heart模拟器与粗粒度分子模拟的交联
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ryo Kanada;Takumi Washio,Seiryo Sugiura,Jun-ichi Okada,Shoji Takada,Yasushi Okuno,and Toshiaki Hisada
  • 通讯作者:
    Takumi Washio,Seiryo Sugiura,Jun-ichi Okada,Shoji Takada,Yasushi Okuno,and Toshiaki Hisada
Efficient Conformational Sampling with an Adaptive Coarse-Grained Elastic Network Model using Bayesian Optimization.
使用贝叶斯优化的自适应粗粒度弹性网络模型进行高效构象采样。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ryo Kanada;Kei Terayama;Atsushi Tokuhisa; and Yasushi Okuno
  • 通讯作者:
    and Yasushi Okuno
Exploring Successful Parameter Region for Coarse-Grained Simulation of Biomolecules by Bayesian Optimization and Active Learning
  • DOI:
    10.3390/biom10030482
  • 发表时间:
    2020-03-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    5.5
  • 作者:
    Kanada, Ryo;Tokuhisa, Atsushi;Terayama, Kei
  • 通讯作者:
    Terayama, Kei
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Kanada Ryo其他文献

イオン刺激応答性DNAアプタマー: IRDAptamerの膜透過メカニズムの解明
离子刺激响应DNA适配体:IRD适配体膜渗透机制的阐明
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yoshizawa Takahiro;Uchibori Ken;Araki Mitsugu;Matsumoto Shigeyuki;Ma Biao;Kanada Ryo;Seto Yosuke;Oh-hara Tomoko;Koike Sumie;Ariyasu Ryo;Kitazono Satoru;Ninomiya Hironori;Takeuchi Kengo;Yanagitani Noriko;Takagi Satoshi;Kishi Kazuma;Fujita Naoya;Okuno Yasus;〇山形優香, 坂野彰則, 齊藤輝, 金子敦巳, 古川和広, 中馬吉郎
  • 通讯作者:
    〇山形優香, 坂野彰則, 齊藤輝, 金子敦巳, 古川和広, 中馬吉郎
Protein-ligand binding affinity prediction of cyclin‐dependent kinase‐2 inhibitors by dynamically averaged fragment molecular orbital‐based interaction energy
通过动态平均片段分子轨道相互作用能预测细胞周期蛋白依赖性激酶 2 抑制剂的蛋白质配体结合亲和力
  • DOI:
    10.1002/jcc.26940
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Takaba Kenichiro;Watanabe Chiduru;Tokuhisa Atsushi;Akinaga Yoshinobu;Ma Biao;Kanada Ryo;Araki Mitsugu;Okuno Yasushi;Kawashima Yusuke;Moriwaki Hirotomo;Kawashita Norihito;Honma Teruki;Fukuzawa Kaori;Tanaka Shigenori
  • 通讯作者:
    Tanaka Shigenori

Kanada Ryo的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

相似海外基金

Understanding of apoptosis of cells on nanostructured substrates utilizing all-atomic analyses of integrin signal
利用整合素信号的全原子分析了解纳米结构基底上的细胞凋亡
  • 批准号:
    20K20545
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 1.75万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了