A stochastic description of protein conformational transition by global landscape calculation

通过全局景观计算随机描述蛋白质构象转变

• 批准号: 19K06597
• 负责人: Terada Tomoki
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-01 至 2022-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K06597/
• 关键词: タンパク質の構造転移; アロステリック転移; 粗視化モデル; 分子動力学計算; ランドスケープ描像; エネルギーランドスケープ理論

项目成果

カメレオンモデルによるアデニル酸キナーゼの構造転移の研究

利用变色龙模型研究腺苷酸激酶的结构转变

• 发表时间: 2021
• 作者: 吉田樹生;笹井理生;寺田智樹
• 通讯作者: 寺田智樹

Free energy landscape analysis of conformational transition of NtrC by chameleon model

变色龙模型对 NtrC 构象转变的自由能图谱分析

• 发表时间: 2021
• 作者: 永田大晴;笹井理生;寺田智樹
• 通讯作者: 寺田智樹

Conformational transition of adenylate kinase studied with the improved chameleon model

用改进的变色龙模型研究腺苷酸激酶的构象转变

• 发表时间: 2019
• 作者: Ryota Mori;Masaki Sasai;Tomoki P. Terada
• 通讯作者: Tomoki P. Terada

Conformational transition of NtrC elucidated by the improvement of dihedral angle potential in chameleon model

变色龙模型中二面角势的改进阐明了 NtrC 的构象转变

• 发表时间: 2020
• 作者: Taisei Nagata;Masaki Sasai;Tomoki P. Terada
• 通讯作者: Tomoki P. Terada