コレラ菌における染色体数のバリエーションに関する研究

霍乱弧菌染色体数目变异的研究

• 批准号: 19K07551
• 负责人: 山本 章治
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: National Institute of Infectious Diseases
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K07551/
• 关键词: コレラ菌; 単一染色体; 複製; 組換え; プラスミド様配列; 表現型; 合成致死; PCR; 遺伝子発現

昨年度はコレラ菌の単一染色体株V060002（Single Chromosome（SC）株）の染色体が2本に分離したバリアント（Two Chromosome（TC）株）をスクリーニングするとともに、両者の増殖能を比較した。本年度はSC株とTC株における遺伝子発現の違いを明らかにするためにRNA-seqを行った。その結果、SC株ではTC株に比べてリボース取り込み系の遺伝子群とCTXファージの複製に関わる遺伝子群の発現がそれぞれ約16倍と約4倍に上昇していた。また、染色数の変動を解析するためのレポーター系を用いてTCからSCへの変換に関わる因子について探索したところ、V060002のゲノムに特異的にコードされる約28 kbpの遺伝子クラスターが重要な役割を担うことが示唆された。この遺伝子クラスターはSalmonella Genomic Island-1（SGI-1）と相同性が高いため、Vibrio Genomic Island-1（VGI-1）と命名した。SGI-1は染色体からの切り出しと複製に関わる遺伝子や接合伝達開始点oriTをコードしているなどプラスミド様の特徴をもつが、その自律的複製と接合伝達を活性化するためにはヘルパープラスミドを導入する必要がある。そこでVGI-1とヘルパープラスミドpVCR94を共存させたところ、両者が単独で存在する場合に比べてTCからSCに変換される効率が100倍以上に上昇した。この結果から、pVCR94の存在下で活性化されるVGI-1由来の因子が単一染色体化を誘導しているものと考えられた。

In the past year, Two chromosomes of the Single Chromosome (SC) strain V060002 were isolated from the two chromosomes of the Single Chromosome (SC) strain. This year, SC and TC strains have been identified by RNA-seq. As a result, SC strain was about 16-fold higher than TC strain in terms of gene expression. For example, the number of stain changes and the number of stain changes are analyzed. The number of stain changes and the number of stain changes. The number of stain changes and the number of Salmonella Genomic Island-1 (SGI-1) and Vibro Genomic Island-1 (VGI-1) are named after the same species. SGI-1 is necessary for chromosome cleavage, replication, gene transfer, conjugation, initiation, oriT, auto-replication, conjugation, activation, and introduction. When VGI-1 and VCR-94 coexist, the rate of VGI-1 and VCR-94 increases by more than 100 times compared with TC and SC. As a result, VGI-1 was activated in the presence of pVCR94 and induced by a chromosome.

项目成果

消化器病学サイエンス

胃肠病学

• 发表时间: 2018
• 作者: 塩川雅広;児玉裕三;塩川雅広
• 通讯作者: 塩川雅広

単一染色体を保有するコレラ菌株の解析

含有单染色体的霍乱菌株分析

• 发表时间: 2020
• 作者: Yokoi T;Nishiyama K;Kushida Y;Uribayashi K;Kunihara T;Fujimoto R;Yamamoto Y;Ito M;Miki T;Haneda T;Mukai T;Okada N.;山本章治
• 通讯作者: 山本章治