NASH肝癌発生過程を血液と肝臓プロテオームから解き明かす～ブタからヒトへ～

点击翻译按钮获取中文摘要

ブタ正常肝臓とNAFLD肝癌肝臓の連続切片（厚さ10μm）をそれぞれ一枚ずつ準備し、一枚は質量分析イメージング（rapifleX；Bruker社）、もう一枚はLC-MS/MS（timsTOF pro; Bruker社）によるショットガン解析に供した。LC-MS/MSの測定データをProteinScape（Bruker社）にて解析することにより、正常肝臓切片から222個、NAFLD肝癌肝臓切片から194個のPeptideあるいはProtein IDを得た。そのうち、癌特異的PeptideあるいはProteinは74個であった。一方、質量分析イメージングにより得られたMS numberと先のショットガンデータをmergeすることにより、癌部に視覚的にも高発現する10個のProteinを抽出した。しかし、本手法はMS numberの小数点以下の確からしさに課題があり、実際MS numberの整数部が一致しているPeptide/Proteinが複数ある場合には、いずれが求めるMS imagingの分布を示す正しいPeptide/Proteinなのか、他の手法でvalidationを要する。今年度、我々は新たにPEAKS Q software（インフォコム社）を使用し、Label-freeの定量解析を追加した。本解析により、先に同定した10個の癌部高発現Peptide/Proteinのうち、以下の7個のvalidationが得られた。①Glutamate dehydorogenase 1,②Vimentin,③Serum albumin, ④Myosin-9, ⑤Complement C3, ⑥Malate dehydrogenase, ⑦60S ribosomal protein L29。