我が国のヒトバベシア症病原体における多様性の解明

日本人类巴贝斯虫病病原体多样性的阐明

• 批准号: 18K06398
• 负责人: 新倉 綾
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: National Institute of Infectious Diseases
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2018
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2018-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18K06398/
• 关键词: 次世代シークエンス; 全ゲノムシークエンス; 遺伝的多様性; Babesia; 全ゲノム解析; ピロプラズマ

NCBIのBabesia microti referenceとなっている RI株ゲノムでは、染色体が合計4本で、ゲノムサイズはアピコンプレックス門（Apicomplexa）の中で最小の6.4MBである。本研究で、B. microti-groupに属する日本の分離株3系統、US系統、神戸系統、穂別系統とB. rodhaini .の全ゲノム配列をpacbioおよびIluminaのシークデータをもとに決定した。染色体本数は全てにおいて、RIと同様の4本であるが、全ゲノムサイズは穂別系統でＲＩより数％程度短かいことが明らかとなった。イントロンに着目してアノテーションを行い、以下の結果を得た。１．イントロンの多くが極端に短く20~25ntに集中している（極小イントロン）２．一方で、同一遺伝子内に極小イントロン以外のイントロンも混在している。３．オーソログ遺伝子においては、US、穂別、神戸系統のイントロンの殆どは極小イントロンで、B. rodhaniのそれは19nt にまで短縮している。さらに、複数個のオーソログ遺伝子を抽出してイントロン・エキソン構造を詳細に比較したところ、イントロンの位置、フェーズ、極小イントロンのサイズはよく保存されていた。ベクター媒介性原虫であるB. microti は自然界において、レゼルボア（clonal expansion）とベクターマダニ（sexual expansion） を交互に感染する。B. rodhainiは実験用マウスを用いて維持継代されてきた実験室株であり、マダニのステージでおこる生殖ステップを欠いている。動物継代のみで長期間維持した結果、イントロン長が変化したのか、それとも、すでに分離時に短縮していたのかは不明である。この点において、動物実験による検証が必要である。

NCBI's Babesia microti reference RI strain In this study, B. The microti-group belongs to Japanese isolate 3 system, US system, Kobe system, and B system. rodhaini . The whole arrangement of pacbio and Ilumina is determined. The chromosome number is completely different from that of the other four. The following results were obtained: 1. The number of entries in the list is extremely short, 20~25nt, concentrated, and 2. The number of entries in the list is extremely small, except for the entries in the same list. 3. The software development of the software development system, US, different, and the system development of the software development system, B. Rodhani's name is 19nt. In addition, a plurality of software components are extracted and compared in detail. The position of the software components, the software components and the software components are stored in the software components. A vector protozoa is B. Microti is the natural world, and it is the interaction between clonal expansion and sexual expansion. B. Rodhaini is the only one who can maintain his position. The animal's long term maintenance results in long term changes in length and separation. This is the point where animals need to be identified.

项目成果

Genetic polymorphism and amino acid sequence variation of Babesia divergens Bd37 in Ixodes persulcatus and Cervus nippon in Japan

日本间沟硬蜱和日本鹿巴贝斯虫 Bd37 遗传多态性及氨基酸序列变异

• 发表时间: 2018
• 作者: A. Zamoto-Niikura;Imaoka K;Morikawa S;Hagiwara K;Ishihara C;Hanaki K
• 通讯作者: Hanaki K

Epidemiological Survey of <i>Babesia divergens</i> Asia Lineage in Wild Sika Deer (<i>Cervus nippon</i>) by Using Direct PCR in Japan

日本野生梅花鹿 (<i>Cervus nippon</i>) 巴贝斯虫亚洲谱系的直接 PCR 流行病学调查

• DOI: 10.7883/yoken.jjid.2019.096
• 发表时间: 2020
• 期刊: Japanese Journal of Infectious Diseases
• 影响因子: 2.2
• 作者: Zamoto-Niikura Aya;Hagiwara Katsuro;Imaoka Koichi;Morikawa Shigeru;Ishihara Chiaki;Hanaki Ken-Ichi
• 通讯作者: Hanaki Ken-Ichi

Investigation of Tick-borne Pathogens in Ticks on Rishiri Island, Hokkaido, Japan

日本北海道利尻岛蜱虫中蜱传病原体的调查

• 发表时间: 2020
• 期刊: Rishri Studies
• 作者: Zamoto-Niikura A.;M. Sato;H. Kawabata;K. Sato-Okubo;S. Ando;C. Ishihara & K. Hanaki.
• 通讯作者: C. Ishihara & K. Hanaki.

Finding of Ixodes pavlovskyi (Acari, Ixodidae) from Oriental Greenfinch, Chloris sinica, on Rishiri Island, northren Hokkaido

北海道北部利尻岛东方绿翅雀、Chloris sinica 中发现巴甫洛夫斯基硬蜱（螨虫、蜱科）

• 发表时间: 2021
• 期刊: Rishri Studies
• 作者: Masahiko Sato;Mamoru Takahashi and Aya Zamoto-Niikura.
• 通讯作者: Mamoru Takahashi and Aya Zamoto-Niikura.

Development ELISA system based on recombinant Bd37 proteins of Babesia divergens Asia-lineage

开发基于巴贝虫亚洲谱系重组Bd37蛋白的ELISA系统

• 发表时间: 2021
• 作者: Sayama Yusuke;Zamoto-Niikura Aya;Matsumoto Chieko;Saijo Masayuki;Ishihara Chiaki;Matsubayashi Keiji;Nagai Tadashi;Satake Masahiro;Aya Zamoto-Niikura
• 通讯作者: Aya Zamoto-Niikura