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ダニ類最後のエニグマ（謎）：ニセササラダニ類の進化的変遷

螨虫最后的谜团：沙拉假螨的进化变化

基本信息

批准号：
18K06392
负责人：
島野智之
金额：
$ 2.75万
依托单位：
Hosei University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2018
资助国家：
日本
起止时间：
2018-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

昨年に引き続き，胸板ダニ類の系統推定において，核遺伝子では18S rRNAや28S rRNA(主にD3領域)，EF1-alpha，HSP82が，ミトコンドリア遺伝子ではCOIが主に用いられている.今年度行ったショットガンシーケンスでは，最小5ngの抽出DNAよりほぼすべての上述のマーカーを含む塩基配列決定が可能であった.個体が小さいためDNA およびRNA量の確保が難しい分類群であるダニ類において，エタノール固定された1個体からでも系統推定に十分な配列を確保する方法を運用している．超並列シークエンサーから出力される配列データは以下の流れでの配列決定方法を確立した.出力ファイル(fastq)をfastpでのフィルター処理の後，GetOrganelleでのアセンブリを行う.続いて，Ugeneでのde noveアセンブリを行い，その結果をBandageに読み込ませ，各種遺伝子配列捜索を行い.さらにCLC Genomics Work Benchでのde novoアセンブリとmap readによる確定を行っている．これらに基づいた，分岐年代推定の方法を確立した．現在，それぞれの分類群の分岐年代の推定に，取り組んでいる．また，ミトコンドリアの遺伝子配列についても，考察をすすめている．また，ヤワスジダニ科のカタツムリダニの2新亜種について記載を行った(Waki et al., 2022)．日本産のトキについていたウモウダニ2種の再記載（Waki and Shimano, 2022），コアホウドリから得られた2種のウモウダニの再記載と記録をおこなった（Waki et al., 2022）．市民科学と生物種の保全のためSNSを媒体としたササラダニの新種記載を行った（Pfingstl et al, 2022）．

In 2005, the system of breast plate was putative, and the nuclear gene was 18S rRNA, 28S rRNA(main D3 domain), EF1-alpha, HSP82, and COI. This year, the minimum amount of DNA extracted is 5ng. The method for ensuring the alignment of individuals with small DNA and RNA amounts is applied to taxonomic groups and to the identification of individuals with small DNA and RNA amounts. The method for determining the arrangement of the following flows is established. After processing, GetOrganelle will send you a message (fastq). In the middle of the game, Ugene has no de novo access to the game, and all the results are in the Bandage. CLC Genomics Work Bench de novo access to the map read to determine how to proceed. A method for estimating the age of divergence is established. Now, we can estimate the age of divergence of taxa, and choose the group. A survey was conducted on the relationship between the two groups. 2 new species of (Waki et al., 2022). 2 species re-recorded in Japan (Waki and Shimano, 2022), 2 species re-recorded in Japan (Waki et al., 2022）. Civic Science and Biological Species Conservation and SNS Media and Records of New Species (Pfingstl et al, 2022).

项目成果

期刊论文数量（73）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

<i>Riccardoella</i> mites infecting six land snail species, referred to in the Red Data List and the Red Data Book

感染红色数据列表和红色数据手册中提到的六种陆地蜗牛的<i>Riccardoella</i>螨

DOI：
10.19004/taxa.46.0_34
发表时间：
2019
期刊：
Taxa, Proceedings of the Japanese Society of Systematic Zoology
影响因子：
0
作者：
脇司;島野智之;浅見崇比呂
通讯作者：
浅見崇比呂

A new species of Japanese oribatid mite, Zachvatkinibates erimo sp. nov., showing sexual dimorphism (Acariformes: Oribatida: Punctoribatidae).

日本甲螨新种 Zachvatkinibates erimo sp.

DOI：
10.11646/zootaxa.4647.1.22
发表时间：
2019
期刊：
Zootaxa
影响因子：
0.9
作者：
Shimano;S. and Aoki;J.
通讯作者：
J.

Supplementary descriptions of Pergalumna amamiensis Aoki, 1984 (Acariformes, Galumnoidea) from Ryukyu Islands.

来自琉球群岛的 Pergalumna amamiensis Aoki，1984（螨形目，Galumnoidea）的补充描述。

DOI：
10.11646/zootaxa.4647.1.24
发表时间：
2019
期刊：
Zootaxa
影响因子：
0.9
作者：
Hagino;W. and Shimano;S.
通讯作者：
S.

A new species of the genus Arrup from a limestone cave in Akiyoshi-dai, Western Japan (Chilopoda, Geophilomorpha, Mecistocephalidae)

日本西部秋吉台石灰岩洞穴中的阿鲁普属新种（Chilopoda、Geophilomorpha、Mecistocephalidae）

DOI：
10.3897/zookeys.830.33060
发表时间：
2019
期刊：
ZooKeys
影响因子：
1.3
作者：
Tsukamoto Sho;Shimano Satoshi;Murakami Takashi;Hiruta Shimpei F.;Yamasaki Takeshi;Eguchi Katsuyuki
通讯作者：
Eguchi Katsuyuki

なぜダニ類は昆虫以外の陸上節足動物の中で最も種数が多いのか?

为什么螨虫是除昆虫以外的陆地节肢动物中种类最多的？

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
Nakamura Masako;Nakajima Yuichi;Watanabe Hiromi Kayama;Sasaki Takenori;Yamamoto Hiroyuki;Mitarai Satoshi;島野智之
通讯作者：
島野智之

DOI：
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作者：
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島野智之其他文献

第5章森のダニ 1（分解者）．In:「ダニのはなし-人間との関わり-』（島野智之・高久元編）

第5章森林螨1（分解者）。

DOI：
发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
0
作者：
Turtle Extinctions Working Group [A.G.J. Rhodin;S. Thomson;G. Georgalis;H.-V. Karl;I.G. Danilov;Akio Takahashi;M.S. de la Fuente;J.R. Bourque;M. Delfino;R. Bour;J.B. Iverson;H.B. Shaffer;P.P. van Dijk];島野智之;髙橋亮雄;髙橋亮雄;島野智之;青木淳一・島野智之・高久元;Akio Takahashi;島野智之
通讯作者：
島野智之

ハクサンハタザオの標高適応解析：中間標高帯における選択が適応分化に影響するか？

中华白杨的海拔适应分析：中海拔区域的选择是否影响适应性分化？

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
島野智之;長谷川元洋;萩原康夫;吉田直史・森長真一・若宮健・石井悠・久保田渉誠・彦坂幸毅
通讯作者：
吉田直史・森長真一・若宮健・石井悠・久保田渉誠・彦坂幸毅

『創造の理論と心理学の諸問題』誌におけるП.К.エンゲリメイエルの創造の理論

П.К.《创造论与心理学问题》中的创造论

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
永宗喜三郎;島野智之;矢吹彬憲;小俣智史
通讯作者：
小俣智史

ニホンイシガメと日本産のクサガメの化石および骨格残骸の記録に関する新知見．

关于日本池塘龟和日本草蛉龟化石和骨骼遗骸记录的新发现。

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
0
作者：
Turtle Extinctions Working Group [A.G.J. Rhodin;S. Thomson;G. Georgalis;H.-V. Karl;I.G. Danilov;Akio Takahashi;M.S. de la Fuente;J.R. Bourque;M. Delfino;R. Bour;J.B. Iverson;H.B. Shaffer;P.P. van Dijk];島野智之;髙橋亮雄;髙橋亮雄;島野智之;青木淳一・島野智之・高久元;Akio Takahashi;島野智之;髙橋亮雄・中島彩智・野島永・安部みき子・亀崎直樹
通讯作者：
髙橋亮雄・中島彩智・野島永・安部みき子・亀崎直樹

沖縄県石垣島の上部更新統から発見されたイタチ類の分類学的位置づけとその動物地理学的意義

冲绳县石垣岛上更新世发现的鼬科动物的分类定位和动物地理学意义

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
0
作者：
Turtle Extinctions Working Group [A.G.J. Rhodin;S. Thomson;G. Georgalis;H.-V. Karl;I.G. Danilov;Akio Takahashi;M.S. de la Fuente;J.R. Bourque;M. Delfino;R. Bour;J.B. Iverson;H.B. Shaffer;P.P. van Dijk];島野智之;髙橋亮雄;髙橋亮雄;島野智之;青木淳一・島野智之・高久元;Akio Takahashi;島野智之;髙橋亮雄・中島彩智・野島永・安部みき子・亀崎直樹;島野智之・高久元;高橋亮雄・太田英利
通讯作者：
高橋亮雄・太田英利