AI-supported studies of RNA viruses

AI 支持的 RNA 病毒研究

• 批准号: 18K07151
• 负责人: Wada Kennosuke
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Nagahama Institute of Bio-Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2018
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2018-04-01 至 2022-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18K07151/
• 关键词: 新型コロナウイルス; COVID-19; 人獣共通感染症; AI; RNAウイルス; ウイルス進化; オリゴヌクレオチド; 自己組織化マップ; SARS-CoV-2; oligonucleotide; RNA virus; host adaptation; pandemic; evolution; big data; エボラウイルス; 新興感染症; 人工知能; ビッグデータ解析; 機械学習; インフルエンザウイルス; デング熱ウイルス; ジカ熱ウイルス; mi

项目成果

Oligonucleotide usage in coronavirus genomes mimics that in exon regions in host genomes

冠状病毒基因组中寡核苷酸的使用模仿宿主基因组外显子区域的寡核苷酸使用

• DOI: 10.21203/rs.3.rs-1604205/v1
• 发表时间: 2022
• 期刊: Research Square
• 作者: Iwasaki Y;Abe T;Ikemura T
• 通讯作者: Ikemura T

Time-series analysis of directional sequence changes in SARS-CoV-2 genomes and an unsupervised explainable AI for studying corona virus genomes

SARS-CoV-2 基因组定向序列变化的时间序列分析以及用于研究冠状病毒基因组的无监督可解释人工智能

• 发表时间: 2020
• 作者: Hirofumi Nariya;Taiki Tamura;Toshi Shimamoto;Tadashi Shimamoto;Kenzo Tokunaga;Toshimichi Ikemura
• 通讯作者: Toshimichi Ikemura

Unsupervised explainable AI for simultaneous molecular evolutionary study of forty thousand SARS-CoV-2 genomes

• DOI: 10.1101/2020.10.11.335406
• 发表时间: 2020-10
• 期刊: bioRxiv
• 作者: T. Ikemura;K. Wada;Y. Wada;Y. Iwasaki;Takashi Abe

宿主細胞特異的な環境に依存した SARS-CoV-2 連続塩基組成の変化

SARS-CoV-2 序列碱基组成的变化取决于宿主细胞特定的环境

• 发表时间: 2021
• 作者: 岩﨑裕貴 ;阿部貴志 ;池村淑道
• 通讯作者: 池村淑道

時系列解析とAIを用いた感染症RNAウィルス増殖に関与する宿主 miRNAの推定

使用时间序列分析和 AI 估计参与传染病 RNA 病毒复制的宿主 miRNA

• 发表时间: 2018
• 作者: 和田健之介;和田佳子;池村淑道
• 通讯作者: 池村淑道