遺伝子ネットワークに基づくバキュロウイルス感染戦略の解明

基于基因网络阐明杆状病毒感染策略

• 批准号: 16J40248
• 负责人: 松田(今井) 典子
• 金额: $ 2.08万
• 依托单位: Meiji University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2016
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2016-04-22 至 2019-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16J40248/
• 关键词: バキュロウイルス; 対応分析法; カイコ核多角体病ウイルス; 構造タンパク質; ユビキチン; 遺伝子ネットワーク

前年度に引き続き対応分析による解析を行い、バキュロウイルス感染によって発現が抑えられる宿主遺伝子の抽出を試みた。対応分析法によって抽出されたウイルス遺伝子と逆の発現パターンを示す宿主遺伝子をスクリーニングしたが、有意なリードカウントを示す遺伝子は得られなかった。一方、ウイルス感染時に、互いに類似した発現パターンを示す宿主遺伝子のネットワーク中にユビキチン関連の遺伝子群が存在した。また、培養細胞を用いた感染実験により、ユビキチンの感染への寄与が示唆されるデータが得られた。そこで、本年度はウイルス遺伝子の構造タンパク質であるユビキチンの生化学的な解析を中心に行った。前年度に未達成であった、タグ融合型ユビキチンを含有するウイルスの作製を再度試みた。感染条件を調整し、タグ融合型ユビキチンを発現する細胞系にウイルスを感染させた。出芽ウイルスを精製しウェスタンブロッティングを行ったところ、シグナルが検出され、タグ融合型ユビキチンもウイルスの構造タンパク質として機能し得ることが示された。一方、バキュロウイルスはユビキチンのホモログをコードすることが知られている。ウイルスユビキチンを欠損させたウイルス粒子をウェスタン解析したところ、野生型ウイルスで検出される、他の因子に結合していると考えられる複数のシグナルのうち１つが消失した。また、ウイルスユビキチンの点変異ウイルスを作製し、同様の実験を行ったところ、前述のシグナルの消失につながるアミノ酸変異を複数見いだした。すなわち、ウイルスユビキチンは宿主ユビキチンと同様ウイルス粒子に含有され、何らかの因子と結合する可能性が示された。本研究により、バキュロウイルスが感染時に利用する遺伝子ネットワークの解明に向けた基盤データを得ることができた。今後は各因子を詳細に解析することで、相互作用がどのように感染に寄与しているかが明らかになると考えられる。

In the previous year, the analysis was conducted in order to analyze the line, infection, infection, suppression, host child extraction and test. The method of analysis shows that the host computer does not know what to do, and that it is intended to show that the host computer is not in the process of receiving the information. One party, each other is infected, and the mutual diagnosis type seems to show that there is a failure in the subgroup of the host child cluster. Send and instigate an infection by sending a message or a sign that the infection is successful. This year, the center of the analysis of biochemistry will be established. In the previous year, the previous year failed to complete the test, and the fusion model was not available in the previous year. The condition of infection was adjusted, and the fusion type of infection was detected. The sprouting system is used in the system, and the system is used in the production of the machine. On the other hand, you know, you know. In this case, we need to know that the particles are not available, that is, the wild type, the wild type, and the combination of factors and factors. we need to know that the particles are missing. Please tell me that you are not in the same position as you are, and that you can see the copy of the data. The host has the same concentration as the host, and the possibility of the combination of these factors indicates that the particles contain the same concentration. In this study, during the period of infection, we made use of the information of the whole family to explain that we were able to get the results of the infection. In the future, the factors will be analyzed, and the interaction will be related to the infection.