セントロメア特異的に挿入するレトロトランスポゾンの転移機構の解明
セントロメア特異的に挿入するレトロトランスポゾンの転移機構の解明
批准号:
22KJ0502
负责人:
塚原 小百合
金额:
$2.58万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2023
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2023-03-08 至 2025-03-31
关键词:
中文摘要
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英文摘要
植物において、レトロトランスポゾンは多くの場合不活性化されているが、Copia型レトロトランスポゾンTal1は、シロイヌナズナの形質転換体において転移活性を持ち、セントロメア領域に特異的に挿入する性質をもつ。本研究では、Tal1がセントロメア領域に特異的に挿入するメカニズムについて調べるため、セントロメアターゲッティングに必要な宿主側の因子と、Tal1側の因子を同定することを目的として研究をすすめている。昨年度までの結果から、宿主側の因子の同定については、計画通りに進めるのが難しかったため、今年度はTal1側の因子の同定について研究を進めた。Tal1がセントロメアをターゲットするのとは対照的に、Tal1と同じファミリーに属するレトロトランスポゾンATCOPIA93は、シロイヌナズナゲノムにおいて遺伝子領域に転移する性質を持つ。Tal1のセントロメアターゲティングにTal1配列のどの領域が必要なのかを調べるため、昨年度までにTal1とATCOPIA93とのキメラ配列を複数パターン作成し、それぞれの形質転換体を作成している。今年度は、各キメラ配列の転移挿入先を網羅的に調べるため、トランスポゾン特異的なプライマーを用いたシーケンシングを行った。その結果、Tal1のインテグレースをコードする領域、その中でも特にC末端側の、Tal1とATCOPIA93とで配列が大きく異なる部分を含む領域がセントロメアターゲティングに必要であることを示唆する結果を得た。
期刊论文(1)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Targeted integrations of copia and gypsy retroelements into non-genic repetitive regions in Arabidopsis
将 copia 和 gypsy 逆转录因子定向整合到拟南芥非基因重复区域
DOI:
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发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Sayuri Tsukahara, Akie Kobayashi, Akira Kawabe, Kae Kato, Leandro Quadrana, Basile Laduque , Tetsuji Kakutani]
通讯作者:
Tetsuji Kakutani
転移活性をもつ内在性レトロトランスポゾンのエピジェネティックな制御機構
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批准号:10J03057
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2010
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负责人:塚原 小百合
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依托单位:
海外基金