ハプティスタ系統群における、葉緑体獲得段階の解明

阐明 Haptista 谱系群体的叶绿体获取阶段

• 批准号: 22KJ1663
• 负责人: 東 智範
• 金额: $ 1.41万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ1663/
• 关键词: Haptista; Plastid evolution; Organellar DNA

今年度は、ハプト藻類の葉緑体機能（ゲノムの複製・転写・翻訳、代謝、膜上の透過装置）を解明することを中心に研究を行った。加えて、有中心粒太陽虫１種から抽出したDNA・RNAに対して、それぞれゲノムシーケンス及びRNAシーケンスを行った。その後、ゲノムシーケンスの結果に基づいて得られたゲノムシーケンスデータから、オルガネラDNAの検出を試み、下記2の結果を得た。1．陸上植物や不等毛藻類の核で発現し葉緑体へと輸送されるタンパク質の配列と相同性の高い配列を、既報・未発表併せて18属30種のハプト藻類のゲノムデータもしくはトランスクリプトームデータから検出した。その後、検出された配列が「葉緑体に輸送されるために必要なシグナル」をもつかどうかを、SignalPとTargetPを用いて推定した。これにより、ハプト藻類の核で発現し葉緑体に輸送されると考えられるタンパク質配列を検出した。これらのタンパク質と、既報のハプト藻類の葉緑体ゲノムにコードされているタンパク質の両者の機能を考慮することにより、ハプト藻類の葉緑体機能を推定することができた。2．有中心粒太陽虫1種のゲノムシーケンスデータから、近縁種のオルガネラゲノムの配列と相同性の高い配列を探索した。その結果、有中心粒太陽虫のオルガネラDNAと考えられる断片配列を検出することができた。また、上述の2点の研究成果に加え、本研究の着想に至った仮説を提唱している「不等毛藻類における葉緑体獲得過程」について述べた投稿論文が学術誌に受理された。

This year, the chloroplast function of algae (replication, transcription, metabolism, and membrane transmission devices) is being studied. The DNA and RNA of the first species of helicoid were extracted from the genome. The DNA and RNA of the first species were extracted from the genome. After the test, the results of the test were obtained. The results of the test were as follows 1. A study on the development of chloroplast transport in 30 species of Heterochaete, belonging to 18 genera, has been carried out. After that, the sequence is "chloroplast transport","SignalP" and "TargetP". The nuclear development and chloroplast transport of algae were studied. The chloroplast function of the algae was estimated after the chloroplast function of the algae was considered. 2. A species of helicoid with centrosome grains has to be arranged in the same way as a species of helicoid, and a species of helicoid has to be arranged in the same way. As a result, there is a central particle in the sun worm's DNA. In addition to the above two research results, this research is intended to be presented in the "chloroplast acquisition process of heterochaeta" and submitted to the academic journal.