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硫黄欠乏応答遺伝子群の機能分化解析

缺硫反应基因的功能分化分析

基本信息

批准号：
22KJ2295
负责人：
渡邉むつみ
金额：
$ 2.83万
依托单位：
Nara Institute of Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2023
资助国家：
日本
起止时间：
2023-03-08 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ2295/
关键词：
硫黄代謝硫黄欠乏応答植物二次代謝比較ゲノム解析

项目摘要

硫黄欠乏応答遺伝子であるSDI (Sulfur Deficiency-Induced) は、アブラナ科特異的特化代謝物であるグルコシノレートの生合成の抑制因子であることを先行研究において特定したが、アブラナ科以外の植物種での機能は不明である。本研究では、双子葉作物 (トマト、ダイズ)、単子葉穀物 (イネ) 及びグルコシノレート代謝多型が報告されている作物種を含むアブラナ科6種について、SDIオルソログ遺伝子の機能分化と機能保存性について実験的に解析を行うことで、植物の硫黄欠乏適応代謝機構の包括的な理解を目指す。1) SDIオルソログ遺伝子の特定: 植物22種のSDIオルソログ遺伝子配列を入手し、アミノ酸配列を用いた配列相同性/系統樹解析及びシンテニー領域解析を行い、アブラナ科植物6種、トマト、ダイズ、イネのSDIオルソログ遺伝子群を特定した。さらに、各植物を用いて硫黄欠乏実験を行い、遺伝子発現解析により硫黄欠乏応答性を評価し、SDI候補遺伝子（計26遺伝子）を特定した。また、硫黄欠乏実験の植物サンプルの代謝物分析を行い、硫黄欠乏時に変動する特化代謝物を見出した。2) SDI候補遺伝子の機能解析: 1)で得られたSDI候補遺伝子の過剰発現体やノックアウト変異体の作製に向けて、遺伝子クローニングを開始し、現在までに、候補遺伝子計26遺伝子中、15遺伝子のクローニングが完了した。それらの内、7遺伝子についてはシロイヌナズナを用いた過剰発現体のT1スクリーニングが終了し、現在、遺伝子発現解析や代謝物分析を行っている。また、各植物を用いた形質転換体作製に向けて、カルスを利用した形質転換法や一過的発現法の系を確立中である。3) 植物種間比較ゲノム解析: 1)の解析を他の植物種へ拡張するために、約60種のゲノムデータセットを用いてシンテニーネットワークを構築した。

Sulfur Deficiency-Induced (SDI) is an inhibitor of biosynthesis of sulfur-deficient metabolites specific to the family, and its function is unknown in plant species other than the family. This study aimed to analyze the functional differentiation and functional preservation of dicotyledonous crops, monocotyledonous grains and plants, and to understand the metabolic mechanisms involved in sulfur deficiency in plants. 1)SDI solution vector identification: 22 species of plants SDI solution vector identification, identification of acid sequences, identification of phylogenetic tree and identification of domain, 6 species of plants, identification, identification, identification of SDI solution vectors. In addition, the sulfur deficiency rate of each plant was determined, the sulfur deficiency rate was evaluated, and the SDI candidate genes (26 genes in total) were specified. Metabolite analysis of sulfur deficient plants was carried out, and specific metabolites of sulfur deficient plants were identified. 2)SDI Candidate Function Analysis: 1) SDI Candidate Overtime Occurrence: 2) Different Working Methods: Start, Now, Candidate Number: 26; 15; Complete. In addition, the analysis of 7 genes and metabolites in the T1 gene and T1 gene in the T1 gene were carried out. In addition, the development method system of plant transformation system is being established. 3)Analysis of plant species comparison: 1) Analysis of plant species diversity, about 60 species of plant species diversity, and construction of plant species diversity.