Study of hydroxymethlated DNA and TET gene family in cancer

癌症中羟甲基化 DNA 和 TET 基因家族的研究

• 批准号: 23659610
• 负责人: SATO FUMIAKI
• 金额: $ 2.33万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23659610/
• 关键词: 乳癌; ハイドロキシメチル化; ハイドロオキシメチル化; メチル化; エピジェネティクス; がん; TET

The aim of this study is to clarify the significance of hydroxymethyl CpG (hmCpG) in breast cancer cells. The hmCpG is thought to be the first step in demethylation mechanism of methylated CpG, and to play an important roles in epigenetic gene regulation in cancer. In this study, to screen differentially hydroxymethylated regions (DHMR), we conducted to methylation microarray analysis to identify differentially hypomethylated regions, using ATCC's breast cancer cell line panels. According to the detailed analysis, we identified subtype specific hypomethylated regions in Luminal type and triple negative breast cancers, which would be candidate regions of DHMR.On the other hand, we established a gene induction system of TET1/2/3 gene families, using Lenti-virus vector system. It will help the further functional analysis of TET1/2/3 genes in breast cancer cells.

本研究的目的是阐明羟甲基CpG（hmCpG）在乳腺癌细胞中的意义。hmCpG被认为是甲基化CpG去甲基化的第一步，在肿瘤表观遗传基因调控中起重要作用。在这项研究中，筛选差异羟甲基化区域（DHMR），我们进行了甲基化微阵列分析，以确定差异低甲基化区域，使用ATCC的乳腺癌细胞系面板。在此基础上，我们在Luminal型和三阴性乳腺癌中筛选出了亚型特异的低甲基化区域，为DHMR的候选区域。另一方面，我们利用慢病毒载体系统建立了TET 1/2/3基因家族的基因诱导系统。为进一步研究TET 1/2/3基因在乳腺癌细胞中的功能奠定了基础。

项目成果

乳癌におけるmiR-200a/b/429 クラスターのエピジェネティクス発現調節と上皮間葉形質転換への関与

乳腺癌中miR-200a/b/429簇的表观遗传调控及其参与上皮间质转化

• 发表时间: 2011
• 作者: Sato F;Ito T;Tsuchiya S;Kawaguchi-Sakita N;Shimizu K;Tsujimoto G;Toi M.;Sato F;M. Nakashima;F. Sato;佐藤史顕
• 通讯作者: 佐藤史顕

Development of microRNA-based prediction model of Trastuzumab treatment response for HER2-positive breast cancer using FFPE specimens

使用 FFPE 标本开发基于 microRNA 的 HER2 阳性乳腺癌曲妥珠单抗治疗反应预测模型

• 发表时间: 2013
• 作者: Shimizu T;Satoh K;Tanaka S;Fukumoto Y;Shimokawa H;Fumiaki Sato
• 通讯作者: Fumiaki Sato

Upregulation of neuropilin-1 in human monocyte is induced by RANKL and may be associated with trastuzumab mediated antibody dependent cellular cytotoxicity in breast cancer cells

RANKL 诱导人单核细胞中 Neuropilin-1 的上调，可能与乳腺癌细胞中曲妥珠单抗介导的抗体依赖性细胞毒性有关

• 发表时间: 2013
• 作者: Shimizu T;Satoh K;Tanaka S;Fukumoto Y;Shimokawa H;Fumiaki Sato;Furukawa H;H Aizaki,他;古川博之;Eiji Suzuki
• 通讯作者: Eiji Suzuki

microRNA 発現プロファイルによるHER2 陽性乳癌に対するTrastuzumab感受性予測法の開発

使用 microRNA 表达谱开发 HER2 阳性乳腺癌曲妥珠单抗敏感性预测方法

• 发表时间: 2012
• 作者: 佐藤公雄;福本義弘;杉村宏一郎;三浦裕;後岡広太郎 建部俊介;山本沙織;青木竜男;下川宏明;佐藤史顕
• 通讯作者: 佐藤史顕

乳がん幹細胞分画の網羅的遺伝子プロファイルの解析

乳腺癌干细胞部分的综合遗传谱分析

• 发表时间: 2012
• 作者: Kimio Satoh;Yoshihiro Fukumoto;Koichiro Sugimura; Hiroaki Shimokawa et al.;川口展子
• 通讯作者: 川口展子