Exploration of unknown microbial function through gene expression

通过基因表达探索未知微生物功能

• 批准号: 24651018
• 负责人: MORONO Yuki
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24651018/
• 关键词: 海底下生命圏; 遺伝子発現; 機能遺伝子; 遺伝子機能; 海底下; 未知微生物; evoglow

In this study, we applied Substrate Induced Gene EXpression (SIGEX) method to decipher unknown gene function of environmental microbes. We used drilled subseafloor sediment samples as DNA sources and established highly efficient SIGEX procedure. We could obtain many organo-halogen induced DNA fragments originating diverse microbial genome. Although there are several issue to be solved, this SIGEX approach can be useful technique to explore functions of unknown microbes in variety of environment.

本研究应用底物诱导基因表达（SIGEX）方法对环境微生物未知基因功能进行了研究。我们使用钻取的海底沉积物样品作为DNA源，并建立了高效的SIGEX程序。我们可以从不同的微生物基因组中获得许多有机卤素诱导的DNA片段。尽管还有一些问题需要解决，但这种SIGEX方法可以用于探索各种环境中未知微生物的功能。

项目成果

Cell abundance, metabolic activity, and genetic functions of subseafloor microbes in the South Pacific Gyre

南太平洋环流海底微生物的细胞丰度、代谢活动和遗传功能

• 发表时间: 2012
• 作者: Yuki Morono;Motoo Ito;and Fumio Inagaki
• 通讯作者: and Fumio Inagaki

Technological challenges for the advanced study of deep subseafloor life

深海海底生命高级研究的技术挑战

• 发表时间: 2013
• 作者: Morono;Y.;Ito;M.;Terada;T.;and Inagaki;F.
• 通讯作者: F.

NanoSIMSおよびセルソーティングによる南太平洋環流域堆積物試料中の微生物代謝活性解析

使用 NanoSIMS 和细胞分选分析南太平洋沿岸盆地沉积物样品中的微生物代谢活性

• 发表时间: 2013
• 作者: Morono;Y.;Terada;T.;and Inagaki;F.;諸野祐樹;諸野祐樹,伊藤元雄,寺田武志,稲垣史生
• 通讯作者: 諸野祐樹,伊藤元雄,寺田武志,稲垣史生

海底下における微生物とその代謝・活性－未知の海底下生命圏を紐解くテクニックとその応用

海底微生物及其新陈代谢和活动 - 解开未知海底生物圈的技术及其应用

• 发表时间: 2013
• 期刊: 日本極限環境生物学会誌
• 作者: Futagami;T.;Morono;Y.;Terada;T.;Kaksonen;A. H.;and Inagaki;F.;二神泰基, 諸野祐樹，稲垣史生;諸野祐樹
• 通讯作者: 諸野祐樹

微生物は一億年生きる?-最新の技術で探る海底下生命圏とその生存戦略-

微生物能活一亿年吗？ -利用最新技术探索海底生物圈及其生存策略-

• 发表时间: 2012
• 作者: Morono;Y.;Terada;T.;and Inagaki;F.;諸野祐樹;諸野祐樹,伊藤元雄,寺田武志,稲垣史生;諸野祐樹， 伊藤元雄，寺田武志， 稲垣史生;諸野祐樹,寺田武志,稲垣史生;諸野祐樹
• 通讯作者: 諸野祐樹