Quality control system that monitors ribosomes damaged by verotoxin

监测被维罗毒素损坏的核糖体的质量控制系统

• 批准号: 24657117
• 负责人: KITABATAKE Makoto
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24657117/
• 关键词: リボソーム; 品質管理; RNA

Verotoxin is produced by enterohemorrhagic E. coli. It targets a small domain called SRL (Sarcin-Ricin Loop) in the host ribosomal RNA. The target site of this toxin was precisely determined; however, the consequence of this damage, including the effect on the ribosomal function and the cellular stress-response systems, has not been explored extensively. In this research, we tackled this problem using S. cerevisiae system as a model. We revealed that 25S rRNA with a mutation in SRL is nonfunctional and selectively degraded in vivo. From 5000 mutant strains of the yeast knock-out collection, we identified several strains that accumulate the SRL mutant 25S rRNA. Interestingly, the genes involved in the degradation of the SRL mutant are partially overlapped with those involved in 25S NRD (degradation pathway for another type of nonfunctional 25S rRNA). These results suggest a general quality control mechanism that monitors a wealth of defects caused by a number of reasons.

Verotoxin是由肠出血性大肠杆菌产生的。杆菌它靶向宿主核糖体RNA中称为SRL（Sarcin-Ricin Loop）的小结构域。这种毒素的靶位点被精确地确定;然而，这种损伤的后果，包括对核糖体功能和细胞应激反应系统的影响，尚未被广泛探讨。在这项研究中，我们解决了这个问题使用S。酿酒系统作为模型。我们发现，在SRL突变的25 S rRNA是非功能性的，并在体内选择性降解。从5000酵母基因敲除收集突变株，我们确定了几个菌株积累的SRL突变25 S rRNA。有趣的是，参与SRL突变体降解的基因与参与25 S NRD（另一种非功能性25 S rRNA的降解途径）的基因部分重叠。这些结果表明，一个通用的质量控制机制，监测大量的缺陷所造成的一些原因。

项目成果

「真核生物リボソームRNAの機能を検査し、不良品を分解する共通のメカニズム」

“测试真核核糖体 RNA 功能并降解缺陷产物的常见机制”

• 作者: Fujii,K.;Sakata,T.;Kitabatake,M. and Ohno;M;北畠真;北畠真;北畠真;Makoto Kitabatake;Makoto Kitabatake;北畠真;北畠真;北畠真
• 通讯作者: 北畠真

真核生物リボソームRNAの機能を検査し,不良品を分解する共通のメカニズム

测试真核核糖体 RNA 功能并降解缺陷产物的常见机制

• 发表时间: 2013
• 作者: Fujii,K.;Sakata,T.;Kitabatake,M. and Ohno;M;北畠真;北畠真
• 通讯作者: 北畠真

真核生物リボソームの品質管理

真核核糖体的质量控制

• 发表时间: 2014
• 作者: Fujii,K.;Sakata,T.;Kitabatake,M. and Ohno;M;北畠真
• 通讯作者: 北畠真

機能不全リボソームRNAの分解においてたんぱく質分解経路の果たす役割

蛋白水解途径在功能失调的核糖体 RNA 降解中的作用

• 发表时间: 2012
• 作者: Fujii,K.;Sakata,T.;Kitabatake,M. and Ohno;M;北畠真;北畠真;北畠真;Makoto Kitabatake;Makoto Kitabatake;北畠真
• 通讯作者: 北畠真

40S subunit dissociation and proteasome-dependent RNA degradation in nonfunctional 25S rRNA decay

• DOI: 10.1038/emboj.2012.85
• 发表时间: 2012-05-30
• 期刊: EMBO JOURNAL
• 影响因子: 11.4
• 作者: Fujii, Kotaro;Kitabatake, Makoto;Ohno, Mutsuhito
• 通讯作者: Ohno, Mutsuhito