Systematic analysis of transcription factors in Marchantia polymorpha

地钱转录因子的系统分析

• 批准号: 24658095
• 负责人: KOHCHI Takayuki
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24658095/
• 关键词: 転写因子; ゼニゴケ; 陸上植物進化; 植物発生; 転写制御因子; 苔類ゼニゴケ; 転写制御

Transcription factors are major regulators for various biological processes including development and environmental responses. Arabidopsis thaliana and Physcomitrella patens have 2,000 and 1,200 transcription factors, respectively. The liverwort Marchantia polymorpha is an emerging model organism for developmental and evolutional studies. M. polymorpha occupies a crucial position in the evolution of land plant and has the haploid-dominant life cycle, which provides advantages over diploid plants for molecular genetic analysis. In this study, we identified ca. 300 transcription factors in M. polymorpha by searching our EST and RNA-sequence databases that include more than 20,000 genes. Surprisingly, M. polymorpha had 38 transcription factor families that are common numbers with A. thaliana. These results indicate that redundancy of transcription factors in M. polymorpha should be very low and that M. polymoroha provides suitable system for genetic analysis.

转录因子是包括发育和环境响应在内的各种生物过程的主要调节因子。拟南芥和小立碗藓分别有2,000和1,200个转录因子。地钱是一种新兴的发育和进化研究模式生物。M. polymorpha在陆生植物的进化中占有重要地位，其生活史以单倍体为主，这为分子遗传学研究提供了比二倍体植物更大的优势。在这项研究中，我们发现了CA。300个转录因子。通过搜索我们的EST和RNA序列数据库，其中包括超过20，000个基因。令人惊讶的是，M。polymorpha有38个转录因子家族，与A. thaliana.这些结果表明，M. polymorpha的含量应该很低，并且M.多态性提供了用于遗传分析的合适系统。

项目成果

ゼニゴケ気室形成制御遺伝子NOPPERABO1の単離と解析

苔草气室形成调节基因NOPPERABO1的分离与分析

• 作者: 河内孝之;加藤大貴;西浜竜一;大和勝幸;石崎公庸;Suresh Panthee;水谷未耶，石崎公庸，増田晃秀，桐田啓如，西浜竜一，河内孝之
• 通讯作者: 水谷未耶，石崎公庸，増田晃秀，桐田啓如，西浜竜一，河内孝之

ゼニゴケ研究地平への投射 : オーキシン信号伝達を例に

地钱研究视野的预测：以生长素信号转导为例

• 作者: 河内孝之;加藤大貴;西浜竜一;大和勝幸;石崎公庸
• 通讯作者: 石崎公庸

苔類ゼニゴケにおける光依存的な細胞分裂活性制御機構

地钱中光依赖性细胞分裂活性的调控机制

• 发表时间: 2013
• 作者: 西浜竜一;石崎公庸;河内孝之
• 通讯作者: 河内孝之

Plastid transformation of sporelings and suspension-cultured cells from the liverwort Marchantia polymorpha L., Method Mol.Biol.

来自地钱地钱的孢子体和悬浮培养细胞的质体转化，方法分子生物学。

• 发表时间: 2014
• 作者: Chiyoda;S.;Yamato;K. T.;Kohchi,T.
• 通讯作者: Kohchi,T.

Composition and physiological function of the chloroplast NADH dehydrogenase-like complex in Marchantia polymorpha

• DOI: 10.1111/j.1365-313x.2012.05115.x
• 发表时间: 2012-11-01
• 期刊: PLANT JOURNAL
• 影响因子: 7.2
• 作者: Ueda, Minoru;Kuniyoshi, Tetsuki;Shikanai, Toshiharu
• 通讯作者: Shikanai, Toshiharu