Comprehensive identification of the Pet-1-target genes by chromatin immunoprecipitation assays in RN46A cells derived from the rat raphe nucleus.

通过染色质免疫沉淀测定对源自大鼠中缝核的 RN46A 细胞中 Pet-1 靶基因进行全面鉴定。

基本信息

  • 批准号:
    24659548
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.41万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 财政年份:
    2012
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2012-04-01 至 2014-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

To identify Pet-1 (serotonergic neuron-specific transcription factor)-binding sites in rat raphe nucleus-derived RN46A cells, chromatin-immunoprecipitation (ChIP) assays were performed. It was revealed that Pet-1 binding was inhibited through the neuron-restrictive silencer factor(NRSF)-NRSF binding element(NRSE) system or the potential repressor proteins independent of NRSF. Additionally, the detection of Pet-1 binding to target genes was occasionally difficult even under conditions where Pet-1 was overexpressed. Taken together, to exclude the function of repressor proteins including NRSF may be necessary to identify the Pet-1 binding to its target genes by ChIP assays in RN46A cells. To overcome these difficulties should be required to use RN46A cells as a proper model of central serotonergic neurons and characterize the Pet-1-mediated transcriptional network in serotonergic neurons.
为了鉴定大鼠中缝核衍生的RN 46 A细胞中的Pet-1(肾上腺素能神经元特异性转录因子)结合位点,进行染色质免疫沉淀(ChIP)测定。 研究表明,Pet-1的结合受到神经元限制性沉默因子(NRSF)-NRSF结合元件(NRSE)系统或不依赖于NRSF的潜在阻遏蛋白的抑制。 此外,即使在Pet-1过表达的条件下,检测Pet-1与靶基因的结合有时也很困难。 总之,排除包括NRSF在内的阻遏蛋白的功能对于通过RN 46 A细胞中的ChIP测定来鉴定Pet-1与其靶基因的结合可能是必要的。 为了克服这些困难,应该需要使用RN 46 A细胞作为中枢多巴胺能神经元的适当模型,并表征Pet-1介导的多巴胺能神经元的转录网络。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
ヒトセロトニン4受容体遺伝子発現調節機構 : ERG、EGRおよびNF1による調節
人血清素4受体基因表达调控机制:ERG、EGR和NF1的调控
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Xiaoyong ZHANG;Noriyasu HOMMA;Yoshihiro TAKAI;Yuichiro NARITA;Makoto ABE;Norihiro SUGITA;and Makoto YOSHIZAWA;那和雪乃
  • 通讯作者:
    那和雪乃
Transcriptional regulation of the human tryptophan hydroxylase-2 gene by Lmx1b in RN46A cells
RN46A 细胞中 Lmx1b 对人色氨酸羟化酶 2 基因的转录调控
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kawada R;et al;Nawa Y
  • 通讯作者:
    Nawa Y
Transcriptional regulation of the human serotonin type 4(5-ht4) receptor gene : identification and characterization of novel promoter and enhancer
人血清素 4 型(5-ht4)受体基因的转录调控:新型启动子和增强子的鉴定和表征
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kei Ichiji;Noriyasu Homma;Masao Sakai;Yoshihiro Takai;Yuichiro Marita;Makoto Abe;Norihiro Sugita;Makoto Yoshizawa;Nawa Y
  • 通讯作者:
    Nawa Y
Transcriptional regulation of the human serotonin type 4(5-ht4) receptor gene:identification and characterization of novel promoter and enhancer
人血清素 4 型(5-ht4)受体基因的转录调控:新型启动子和增强子的鉴定和表征
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yukino Nawa;Masanori Ootaki;Rie Kuwabara;Tomoko Hiroi;Ryoya Takahashi;Hiroaki Matsui
  • 通讯作者:
    Hiroaki Matsui
聖マリアンナ医科大学大学院脳情報制御医学分野
圣玛丽安娜大学医学院脑信息控制医学系
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
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