Comprehensive identification of the Pet-1-target genes by chromatin immunoprecipitation assays in RN46A cells derived from the rat raphe nucleus.

通过染色质免疫沉淀测定对源自大鼠中缝核的 RN46A 细胞中 Pet-1 靶基因进行全面鉴定。

基本信息

批准号：
24659548
负责人：
MATSUI Hiroaki
金额：
$ 2.41万
依托单位：
St. Marianna University School of Medicine
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2012
资助国家：
日本
起止时间：
2012-04-01 至 2014-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

To identify Pet-1 (serotonergic neuron-specific transcription factor)-binding sites in rat raphe nucleus-derived RN46A cells, chromatin-immunoprecipitation (ChIP) assays were performed. It was revealed that Pet-1 binding was inhibited through the neuron-restrictive silencer factor(NRSF)-NRSF binding element(NRSE) system or the potential repressor proteins independent of NRSF. Additionally, the detection of Pet-1 binding to target genes was occasionally difficult even under conditions where Pet-1 was overexpressed. Taken together, to exclude the function of repressor proteins including NRSF may be necessary to identify the Pet-1 binding to its target genes by ChIP assays in RN46A cells. To overcome these difficulties should be required to use RN46A cells as a proper model of central serotonergic neurons and characterize the Pet-1-mediated transcriptional network in serotonergic neurons.

为了鉴定大鼠raphe核源性的RN46A细胞中的PET-1（血清素能特异性转录因子） - 结合位点，进行了染色质免疫沉淀（芯片）测定。据表明，PET-1结合通过神经限制性的消音器因子（NRSF）-NRSF结合元件（NRSE）系统抑制了PET-1结合，或独立于NRSF的潜在抑制蛋白。另外，即使在PET-1过表达的条件下，DET-1与靶基因的结合也有时也很困难。综上所述，为排除包括NRSF在内的阻遏蛋白的功能，对于通过RN46A细胞中的CHIP分析鉴定PET-1与其靶基因的结合可能是必要的。为了克服这些困难，应使用RN46A细胞作为中央血清素能神经元的正确模型，并表征PET-1介导的转录网络中的5-羟色源性神经元中的转录网络。

项目成果

期刊论文数量（8）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

ヒトセロトニン4受容体遺伝子発現調節機構 : ERG、EGRおよびNF1による調節

人血清素4受体基因表达调控机制：ERG、EGR和NF1的调控

DOI：
发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
0
作者：
Xiaoyong ZHANG;Noriyasu HOMMA;Yoshihiro TAKAI;Yuichiro NARITA;Makoto ABE;Norihiro SUGITA;and Makoto YOSHIZAWA;那和雪乃
通讯作者：
那和雪乃

Transcriptional regulation of the human tryptophan hydroxylase-2 gene by Lmx1b in RN46A cells

RN46A 细胞中 Lmx1b 对人色氨酸羟化酶 2 基因的转录调控

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kawada R;et al;Nawa Y
通讯作者：
Nawa Y

Transcriptional regulation of the human serotonin type 4(5-ht4) receptor gene : identification and characterization of novel promoter and enhancer

人血清素 4 型（5-ht4）受体基因的转录调控：新型启动子和增强子的鉴定和表征

DOI：
发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kei Ichiji;Noriyasu Homma;Masao Sakai;Yoshihiro Takai;Yuichiro Marita;Makoto Abe;Norihiro Sugita;Makoto Yoshizawa;Nawa Y
通讯作者：
Nawa Y

聖マリアンナ医科大学大学院脳情報制御医学分野

圣玛丽安娜大学医学院脑信息控制医学系