Nano-HPLC gekoppeltes ESl-Massenspektrometer zur Proteomanalyse

纳米液晶电喷雾质谱仪显示了一个新的方向。Das am Standort TU Kaiseretern für die Peptidanalysis zur Verfügung stehende Gerät ist ausgelastet und genügt bezüglich Scanraten，Sensitivität und Massenauflösung bei weitem nicht unseren Anforderungen. 我们用这些小工具来完成以下任务：1.分析蛋白质组中通过染色体畸变（非整倍体）、环境畸变、Wirkstoff-变性或真核生物模型中的一种遗传功能而产生的扰动。我们文登hierfür Markierungen mit stabilen Isotopen（SILAC，15 N）和Massenspektrometrie im Shotgun Verfahren an.该测试的复杂性，通过现代实验，可以获得更高的扫描率，从而获得更高的质量和灵敏度。2.蛋白质-蛋白质-蛋白质相互作用的稳定同位素和免疫沉淀分析，以及二肽的交联分析。Hierfür韦尔登qualitativ hochwertige Fragmentspektren mit hoher Massengenauigkeit benötigt. 3.分析亚蛋白质。4.分析磷酸化蛋白质。5. Analyse von Protein-Lipiden Interaktionen für Membranenanalyze.该仪器是TU Kaiserlestern的系统生物学Schwerpunkt的一个中心元素。

Das beantragte nano-LC ESl-Massenspektrometer stellt eine Neuanschaffung dar. Das am Standort TU Kaiserslautern für die Peptidanalyse zur Verfügung stehende Gerät ist ausgelastet und genügt bezüglich Scanraten, Sensitivität und Massenauflösung bei weitem nicht unseren Anforderungen. Wir verfolgen mit dem beantragten Instrument folgende Ziele: 1. Analysen von Änderungen im Proteom nach Perturbationen durch veränderte Chromosomenzahlen (Aneuploidie), Umweltbedingungen, Wirkstoff-Applikation, oder den Verlust einer Genfunktion in eukaryotischen Modellorganismen. Wir wenden hierfür Markierungen mit stabilen Isotopen (SILAC, 15N) und Massenspektrometrie im Shotgun-Verfahren an. Die hohe Komplexität der Proben, vor allem aus Zeitreihen-Experimenten, erfordert hohe Scanraten bei gleichzeitig hoher Massenauflösung und Sensitivität. 2. Analyse von Protein-Protein-Interaktionen basierend auf stabilen Isotopen und lmmunopräzipitation, sowie Analyse von Dipeptiden aus Crosslink-Ansatzen. Hierfür werden qualitativ hochwertige Fragmentspektren mit hoher Massengenauigkeit benötigt. 3. Analyse von Subproteomen. 4. Analyse von Phosphoproteomen. 5. Analyse von Protein - Lipiden Interaktionen für Membranenanalyse. Das Instrument ist ein zentrales Element für den systembiologischen Schwerpunkt an der TU Kaiserslautern.