ナノLC/MSを用いた高感度・高深度単一細胞メタボローム分析法の開発

使用纳米 LC/MS 开发高灵敏度和深度的单细胞代谢组分析方法

• 批准号: 21K14472
• 负责人: 中谷 航太
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K14472/
• 关键词: シングルセルメタボロミクス; メタボロミクス; ナノ液体クロマトグラフィー質量分析; HILIC; 陰イオン交換クロマトグラフィー; uHILIC/AEX; Nano-uHILIC/AEX/MS

これまでの代謝研究では100万細胞以上を対象とした大量細胞での平均的観測が為されており、単一細胞から100細胞以下の微量細胞試料の測定は困難であった。本研究の目的は、単一細胞から100細胞以下の微量細胞試料からのメタボローム解析方法を開発することである。上記の目的達成のために3つの課題を設定した。1つ目が幅広いメタボロームの分離のための液体クロマトグラフィー手法の開発、2つ目が液体クロマトグラフィー質量分析 (LC/MS) システムの高感度化、3つ目が開発した手法の超微量細胞試料への応用である。2022年度は、1つ目の課題に関して、2021年度に開発した分析手法の論文公開を行った。2つ目の課題に対して、分析法の再現性や耐久性評価といった分析バリデーションを実施した。また、3つ目の課題に対して少数細胞 (10-50個)のメタボローム解析および培養HeLa細胞の1細胞メタボローム解析を実施した。

In the study of more than 1 million cells, the average temperature of a large number of cells is less than 100 cells, and the average temperature of a large number of cells is less than 100 cells. The purpose of this study is to determine the analytical method for the determination of trace amounts of raw materials below 100 cells. The purpose of the previous session is to set the settings for the last three questions. 1

项目成果

親水性メタボローム測定法①：unified-HILIC/AEX/MS

亲水代谢组测定方法①：统一-HILIC/AEX/MS

An analytical system for comprehensive quantitative profiling of bioactive lipids by solid phase extraction combined with LC/MS/MS

通过固相萃取结合 LC/MS/MS 对生物活性脂质进行全面定量分析的分析系统

• 发表时间: 2022
• 作者: 〇Kohta Nakatani;Yoshihiro Izumi;Hironobu Umakoshi;Ayako Hidaka;Masatoshi Ogata;Yoshihiro Ogawa;Takeshi Bamba
• 通讯作者: Takeshi Bamba

高感度nano-uHILIC/AEX/MS/MSによる少数細胞集団試料のメタボローム分析

使用高灵敏度 nano-uHILIC/AEX/MS/MS 对小细胞群样品进行代谢组分析

• 发表时间: 2021
• 作者: Yoshioka T;Izumi Y;Nagatomi Y;Miyamoto Y;Suzuki K;Bamba T*.;〇中谷 航太，和泉 自泰，秦 康祐，高橋 政友，内田 穣，石井 優，馬場 健史
• 通讯作者: 〇中谷 航太，和泉 自泰，秦 康祐，高橋 政友，内田 穣，石井 優，馬場 健史

メタボロミクス実践ガイド

代谢组学实用指南

• 发表时间: 2021
• 作者: 馬場 健史;平山 明由;松田 史生;津川 裕司
• 通讯作者: 津川 裕司

PDZD8-deficient mice accumulate cholesteryl esters in the brain as a result of impaired lipophagy.

• DOI: 10.1016/j.isci.2022.105612
• 发表时间: 2022-12-22
• 期刊: ISCIENCE
• 影响因子: 5.8
• 作者: Morita, Keiko;Wada, Mariko;Nakatani, Kohta;Matsumoto, Yuki;Hayashi, Nahoki;Yamahata, Ikuko;Mitsunari, Kotone;Mukae, Nagi;Takahashi, Masatomo;Izumi, Yoshihiro;Bamba, Takeshi;Shirane, Michiko
• 通讯作者: Shirane, Michiko