メタゲノム解析とQTL解析から探る,植物-土壌微生物群集相互作用機構
メタゲノム解析とQTL解析から探る,植物-土壌微生物群集相互作用機構
批准号:
21K14763
负责人:
番場 大
金额:
$2.91万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
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近年,持続可能な農業の確立が世界的な課題となっている中で,植物と土壌微生物群集の相互作用は,低環境負荷農業を実現する極めて重要な役割を担うと期待されている。そこで,本研究では,植物と土壌微生物群集の相互作用に関連する植物遺伝子座を特定し,微生物群集との相互作用が植物によってどのように規定されるのかを明らかにすることを目的とし,マメ科のモデル植物ミヤコグサを用いて,土壌微生物群集の接種実験,メタゲノム解析,およびQTL解析を組み合わせることで,植物-土壌微生物群集の相互作用機構についてアプローチする。2022年度は2021年度に得られた結果の再解析を含めて研究を進めた.2021年度にはミヤコグサGifu系統とLotus burttii系統との間に作成されたRILsを用いた接種実験を行い,2023年度にはGifu系統とミヤコグサMG20系統との間に作出されたRILsを用いた接種実験を行い,結果を統合する予定であった.しかし,2021年度に利用していた人工気象器の破損に伴い,生育環境を一新する必要性が生じた.そのため,生育環境バイアスを除くために,2023年度においてもLotus burttii系統とのRILsとMG20系統とのRILsについても再度接種実験を行った.また,2021年度の結果では,接種実験の際に1ポット2系統を栽培したところ,ポットとしてのバイアスが検出されたため,同バイアスをできる限り減らすようにすべての個体をランダマイズして栽培した。得られた834個体をの根サンプルはすでに採取済みであり,現在解析を進めている。加えて,解析結果を2021年度の結果と比較し,微生物群集への植物遺伝子座の効果がどれだけロバストなのかを評価したい。
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ミヤコグサ根微生物群集に対するQTLマッピング
莲花根部微生物群落QTL定位
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[番場 大, Akyol Turgut Y, Quilbe Johan, Andersen Stig U, 佐藤 修正]
通讯作者:
佐藤 修正
Aarhus University(デンマーク)
奥胡斯大学(丹麦)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
バイオスティミュラントハンドブック
生物刺激剂手册
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[山内 靖雄, 須藤 修, 和田 哲夫, 日本バイオスティミュラント協議会]
通讯作者:
日本バイオスティミュラント協議会
植物-微生物群集相互作用をとりまく植物,群集,および環境の効果
植物、群落和环境对植物-微生物群落相互作用的影响
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[番場 大 , Turgut Yigit Akyol , 東 優佑 , Stig Uggerhoj Andersen , 佐藤 修正]
通讯作者:
佐藤 修正
番場 大, Akyol Turgut Y, Quilbe Johan, Andersen Stig U, 佐藤 修正
Dai Bamba、Akyol Turgut Y、Quilbe Johan、Andersen Stig U、Sato Correction
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[番場 大, Akyol Turgut Y, Quilbe Johan, Andersen Stig U, 佐藤 修正, ミヤコグサ根微生物群集に対するQTL解析]
通讯作者:
ミヤコグサ根微生物群集に対するQTL解析
共 7 条
進化速度解析から探る根粒型窒素固定共生の構築,維持,躍進プロセス
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批准号:24K18168
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2024
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负责人:番場 大
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依托单位:
ゲノムワイド関連解析を用いたマメ科植物-根粒菌共生特異性の進化動態の解明
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批准号:17J04284
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.79万
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财政年份:2017
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负责人:番場 大
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依托单位:
海外基金