天然物誘導体化による非天然型新規化合物創出を志向した放線菌機能未知遺伝子の解析

Roseophilin（RP）生合成遺伝子のうち、rphG、rphG2、rphG3、rphG4 はStreptomyces coelicolorのprodigioisn（PG）側鎖環化遺伝子redGと相同性を示している。RPと同じ鎖長の側鎖を持つPGを生産するS. coelicolorのredGredP破壊株にrphG、rphG2、rphG3、rphG4の4遺伝子すべてを導入したところ、三箇所で複雑に架橋した環化アルキル側鎖を有する新規PGであるprodigiosin R3を生産した。この結果より、これらの4遺伝子をPG側鎖環化遺伝子と同定し、執筆した論文がJournal of Antibioticsに掲載された。RP生産菌のドラフトゲノム解析により、RPのクロル化に関わると考えられるハロゲナーゼ遺伝子orf16-3がrphクラスター外に見いだされている。orf16-3、orf16-4、orf16-5、orf16-6の隣り合う4遺伝子をundecylprodiginine（UP）生産菌であるS. coelicolor、およびS. coelicolorのredGredP破壊株に導入し、基質としてdechlororoseophilin（DRP）を供給して代謝産物を解析したが、新たなPGは検出されなかった。一方、申請者は現在までに、DRPのフランがピロールに置換したRP生合成中間体であるprodigiosin R2（PGR2）を見いだしている。RP生産菌培養抽出物から得られたPGR2を含むフラクションを分析したところ、PGR2のクロル化体と考えられる代謝産物が検出された。このことから、RP生合成におけるクロル化の基質がPGR2である可能性が示唆されたため、PGR2を基質としたクロル化反応の解析を試みたが、反応溶液からクロル化したPG類は検出されなかった。

Roseophilin（RP）生合成遺伝子のうち、rphG、rphG2、rphG3、rphG4 はStreptomyces coelicolorのprodigioisn（PG）側鎖環化遺伝子redGと相同性を示している。RPと同じ鎖長の側鎖を持つPGを生産するS. coelicolorのredGredP破壊株にrphG、rphG2、rphG3、rphG4の4遺伝子すべてを導入したところ、三箇所で複雑に架橋した環化アルキル側鎖を有する新規PGであるprodigiosin R3を生産した。この結果より、これらの4遺伝子をPG側鎖環化遺伝子と同定し、執筆した論文がJournal of Antibioticsに掲載された。RP生産菌のドラフトゲノム解析により、RPのクロル化に関わると考えられるハロゲナーゼ遺伝子orf16-3がrphクラスター外に見いだされている。orf16-3、orf16-4、orf16-5、orf16-6の隣り合う4遺伝子をundecylprodiginine（UP）生産菌であるS. coelicolor、およびS. coelicolorのredGredP破壊株に導入し、基質としてdechlororoseophilin（DRP）を供給して代謝産物を解析したが、新たなPGは検出されなかった。一方、申請者は現在までに、DRPのフランがピロールに置換したRP生合成中間体であるprodigiosin R2（PGR2）を見いだしている。RP生産菌培養抽出物から得られたPGR2を含むフラクションを分析したところ、PGR2のクロル化体と考えられる代謝産物が検出された。このことから、RP生合成におけるクロル化の基質がPGR2である可能性が示唆されたため、PGR2を基質としたクロル化反応の解析を試みたが、反応溶液からクロル化したPG類は検出されなかった。