ミドリイシ属サンゴの野外での受精成功と交雑状況の解明
ミドリイシ属サンゴの野外での受精成功と交雑状況の解明
批准号:
21K15146
负责人:
北之坊 誠也
金额:
$2.91万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
本研究では、同所的に生息し、多種同調産卵するミドリイシ属サンゴの生殖様式に注目し、現生ミドリイシ属サンゴにおける野外での受精状況と異種間交雑の頻度、子孫の遺伝的多様性の変化を解明することを目的としている。本年度は、以下の研究を行った。17種145サンプルを用いて次世代シークエンサーで得られたデータの解析を開始し、ミドリイシ属サンゴのゲノム科学的研究を進めた。分子系統解析を行い、先行研究と比較してブートストラップ値の高い信頼性のある系統樹を作成した。その結果、現生するミドリイシ属サンゴの交雑能を持つ種間で、同一の共通祖先から分岐した可能性が示唆された。Acropora tenuisとAcropora doneiが最初に分岐し、その後、他のいくつかの種が分岐し、多種同調産卵する種が分化したことが考えられる。また、遺伝子ネットワーク解析では、系統樹の結果を支持する内容として、各クレードを形成するグループが遺伝的には離れており、同じグループ内では遺伝的な交流があったと思われる細かなネットワークが形成されていることが示唆されました。つまり、異なるグループ間では遺伝的な距離が大きく、しかし同じグループ内では遺伝的な交流が行われていた可能性があることを示唆しています。さらに、集団遺伝学解析により、おおよそ7つの集団が形成されていることが示され、系統樹上で近縁なクレードを形成する種が同じクラスターに分類された。この結果から、遺伝的に近い種が同じ集団を形成している可能性が示唆された。
英文摘要
本研究では、同所的に生息し、多種同調産卵するミドリイシ属サンゴの生殖様式に注目し、現生ミドリイシ属サンゴにおける野外での受精状況と異種間交雑の頻度、子孫の遺伝的多様性の変化を解明することを目的としている。本年度は、以下の研究を行った。17種145サンプルを用いて次世代シークエンサーで得られたデータの解析を開始し、ミドリイシ属サンゴのゲノム科学的研究を進めた。分子系統解析を行い、先行研究と比較してブートストラップ値の高い信頼性のある系統樹を作成した。その結果、現生するミドリイシ属サンゴの交雑能を持つ種間で、同一の共通祖先から分岐した可能性が示唆された。Acropora tenuisとAcropora doneiが最初に分岐し、その後、他のいくつかの種が分岐し、多種同調産卵する種が分化したことが考えられる。また、遺伝子ネットワーク解析では、系統樹の結果を支持する内容として、各クレードを形成するグループが遺伝的には離れており、同じグループ内では遺伝的な交流があったと思われる細かなネットワークが形成されていることが示唆されました。つまり、異なるグループ間では遺伝的な距離が大きく、しかし同じグループ内では遺伝的な交流が行われていた可能性があることを示唆しています。さらに、集団遺伝学解析により、おおよそ7つの集団が形成されていることが示され、系統樹上で近縁なクレードを形成する種が同じクラスターに分類された。この結果から、遺伝的に近い種が同じ集団を形成している可能性が示唆された。
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交雑を介した遺伝子浸透が種分化に与える影響―ミドリイシ属サンゴを用いた研究
通过杂交进行基因渗透对物种形成的影响:使用鹿角珊瑚进行研究
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[北之坊 誠也, 古川 真央, 大木 駿, 戸篠 祥, Sanaz Hazraty-Kari, Parviz Tavakoli-Kolour, Tanya Singh, 守田 昌哉, 古川 真央,北之坊 誠也,守田 昌哉, 北之坊 誠也,古川 真央,大木 駿,Sanaz Hazraty-Kari,Parviz Tavakoli-Kolour,Tanya Singh,守田 昌哉, 古川 真央,北之坊 誠也,守田 昌哉]
通讯作者:
古川 真央,北之坊 誠也,守田 昌哉
Reproductive strategies in the hybrid of the coral Acropora florida and A. intermedia
佛罗里达鹿角珊瑚和中间珊瑚的繁殖策略
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kitanobo, S., Isomura, N., Fukami, H., Iwao, K., & Morita, M]
通讯作者:
M
交雑するミドリイシ属サンゴ属の系統解析と遺伝子浸透について
杂交鹿角珊瑚的系统发育分析和基因渗透
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[北之坊 誠也, 古川 真央, 大木 駿, 戸篠 祥, Sanaz Hazraty-Kari, Parviz Tavakoli-Kolour, Tanya Singh, 守田 昌哉, 古川 真央,北之坊 誠也,守田 昌哉, 北之坊 誠也,古川 真央,大木 駿,Sanaz Hazraty-Kari,Parviz Tavakoli-Kolour,Tanya Singh,守田 昌哉]
通讯作者:
北之坊 誠也,古川 真央,大木 駿,Sanaz Hazraty-Kari,Parviz Tavakoli-Kolour,Tanya Singh,守田 昌哉
同所的に生息するテーブル状ミドリイシ属サンゴの生殖と種分化
鹿角珊瑚属同域板状珊瑚的繁殖和物种形成
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[古川真央, 北之坊誠也, 守田昌哉]
通讯作者:
守田昌哉
Timing of spawning and speciation of Acropora divaricata inhabiting around Sesoko island, Okinawa, Japan.
栖息在日本冲绳濑底岛周围的 Acropora divaricata 的产卵时间和物种形成。
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Furukawa, M., S., Kitanobo, S., Morita M]
通讯作者:
Morita M
共 8 条
ミドリイシ属サンゴの配偶子認識から読み解く雑種種分化
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批准号:19J14375
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2019
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负责人:北之坊 誠也
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依托单位:
海外基金