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DPANN群に属する共生アーキア培養株の確立と共生機構の解明

DPANN群共生古菌培养菌株的建立及共生机制的阐明

基本信息

批准号：
21K15153
负责人：
酒井博之
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Soka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、生物界最小クラスの細胞を持つ寄生性アーキアとして知られるDPANNアーキアについて、培養株を可能な限り確立し、その共生機構を解明することを目的としている。酸性温泉試料を分離源として、1）メタゲノムDNA解析/16S rRNAアンプリコン解析を用いた生息域の探索、2）培養株の取得および公的菌株保存機関への寄託、3）宿主との共培養下におけるDPANNアーキアの生理性状解析および形態解析、4）全ゲノム解析、トランスクリプトーム解析およびプロテオーム解析を用いた共生機構の解明を実施する。2022年度は、新たに確立した2株の新規DPANNアーキア（YN1株、YN4株）について、生理性状解析、宿主範囲の調査、電子顕微鏡観察を行った。また、2021年度に確立した集積培養系から、2株の新規DPANNアーキア（KR1株、KR2株）を宿主と共に分離することに成功した。更に、大分県別府温泉で採取した温泉試料から、DPANNアーキアを含む複数の集積培養系を確立することもできた。2023年度は、引き続きDPANNアーキア培養株の生理性状解析を進めるとともに、電子顕微鏡観察、全ゲノム解析、トランスクリプトーム解析、プロテオーム解析等の技術を駆使して共生機構の一端を解明することを目指す。並行して集積培養系からの分離培養も進め、更なるDPANNアーキア培養株を取得する。取得した培養株については、順次、公的菌株保存機関への寄託手続きを進める。

The aim of this study is to understand the parasitic nature of the smallest cell in the biological world, to establish the possible limits of the culture strain, and to clarify the symbiotic mechanism. 1) DNA analysis of acidic hot spring samples and exploration of their habitat; 2) storage of culture strains; 3) analysis of physiological characteristics and morphological characteristics of DPANN under co-culture of hosts; 4) analysis of total DNA; The solution of the symbiotic mechanism is implemented by the solution of the symbiotic mechanism. In 2022, two new DPANN strains (YN 1 strain, YN 4 strain) were established. Physiological character analysis, host model investigation and electronic microscope observation were carried out. In 2021, we established a new set of DPANN strains (KR 1 strain, KR 2 strains) and successfully isolated the host. In addition, the hot spring samples collected from Beppu Hot Spring in Oita Prefecture were used to establish a culture system containing a plurality of aggregates. In 2023, we will introduce new technologies to analyze physiological characteristics of DPANN, such as electron microscopy, total analysis, selection analysis, and selection analysis. In parallel, the collection culture system is divided into two parts: isolation culture and acquisition of DPANN culture. To obtain the culture strains, we need to keep them in order and in good order.