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Prognostic prediction and heterogenetic visualization of pancreatic cancer by histologic and genomic analysis

通过组织学和基因组分析进行胰腺癌的预后预测和异基因可视化

基本信息

批准号：
21K15393
负责人：
高松学
金额：
$ 3万
依托单位：
Japanese Foundation for Cancer Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

この研究では、人工知能を活用した多数例の病理組織学的な形態解析を通じて、不均一な細胞集団である浸潤性膵管癌における新規形態学的分類法の構築と、それぞれの形態分類に対応する特異的な発現変化を示す遺伝子群を同定する。そして、推定される遺伝子変化を組織形態学へ効果的に翻訳し、腫瘍全体の不均一性の可視化を実現するとともに、予後や再発後の化学療法効果を予測するモデルを確立する。令和3年度は浸潤性膵管癌674症例からデジタル化した組織画像を基に癌を含む小画像（パッチ画像）を100万枚余り収集し、特徴量の抽出から予後予測モデルを確立した。令和4年度は、上記で収集した組織画像を基に、ニューラルネットワークを介したクラスタリングにより、不均一な癌画像を類似画像よりなる16クラスタに分解し、それぞれのクラスタの出現頻度を同定した。さらに予後に有意な影響を与えるクラスタを3つ同定した。特に、一定数以上存在すると膵癌術後再発が非常に高率となる、あるいは反対にその成分が存在しなければ5年無再発率50%以上となるような症例抽出に成功した。検証用データ130症例全体における再発率は85%程度であるため、予後良好群のリスク層別化は患者に正確な情報を提供し適切な補助療法の選択に繋げることができる。上記のようなクラスタに属する組織におけるmRNAのパネル定量を実施することで、予後に影響を与える分子が同定できると考えられる。

This research has utilized human knowledge to analyze the morphology of most cases of pathohistology, and to establish new morphological classification methods for invasive ductal carcinoma. The results of histomorphology and tumor heterogeneity can be visualized, predicted, and established. In 2003, 674 cases of invasive ductal cancer were collected, and the characteristics were extracted and predicted. In 2010 and 2014, the frequency of tissue images collected from the database was the same as that recorded in the database. After the first three months of the year, the number of people affected by the disease increased significantly. In particular, there are more than a certain number of patients who have a very high recurrence rate after cancer surgery. The recurrence rate of all 130 cases was 85%, and the classification of patients was improved to provide accurate information for the selection of appropriate adjuvant therapy. Note that the expression of mRNA in the tissue belongs to the same group as that in the molecule.