Identification of somatic mutations promoting progression of EGFR-mutated lung adenocarcinoma

我々の研究ではこれまでに、EGFR変異を有する肺腺癌（以下、EGFR肺腺癌）の悪性度が微小乳頭状亜型により規定されていることを明らかにした。更に同一腫瘍から微小乳頭状成分と非微小乳頭状成分をマイクロダイセクションで採り分け、次世代シーケンサーによる全エクソン解析を行い、微小乳頭状成分のみに起こっている遺伝子変異を同定、特に高悪性化に関連すると予想される20個の遺伝子からなる「高悪性度EGFR肺腺癌パネル」を作成した。このパネルを用いて、候補遺伝子の変異が①本当に微小乳頭状成分に特異的な変異であるのか、②EGFR肺腺癌の悪性度、すなわち増殖活性・脈管侵襲性や予後に相関するのかを検証する予定である。この研究により、EGFR肺腺癌の高悪性度化に関わる主要な後発変異を同定し、新規の予後予測マーカーや分子標的指標の確立に繋げたい。今までに、切除材料（外科症例）のEGFR肺腺癌凍結検体から、微小乳頭状成分(20例)と非微小乳頭状成分(10例)を切り分け、この30症例に対して候補遺伝子のCDS領域をターゲットにした変異解析(amplicon panel sequence)を行った。その結果、微小乳頭状成分が多く含まれるクラスターに、p53をはじめとする複数の遺伝子変異がより多く含まれていることが示された。当該年度は、新技術である「Visium 空間的遺伝子発現解析」を用いて、組織像を対比させることで、微小乳頭状成分と非微小乳頭状成分それぞれの遺伝子発現パターンを解析し、微小乳頭状成分で特異的に発現上昇している遺伝子変異3個と、発現低下している遺伝子20個を同定した（松村舞依 他, 日本病理学会学術総会, 2023年)。

我々の研究ではこれまでに、EGFR変異を有する肺腺癌（以下、EGFR肺腺癌）の悪性度が微小乳頭状亜型により規定されていることを明らかにした。更に同一腫瘍から微小乳頭状成分と非微小乳頭状成分をマイクロダイセクションで採り分け、次世代シーケンサーによる全エクソン解析を行い、微小乳頭状成分のみに起こっている遺伝子変異を同定、特に高悪性化に関連すると予想される20個の遺伝子からなる「高悪性度EGFR肺腺癌パネル」を作成した。このパネルを用いて、候補遺伝子の変異が①本当に微小乳頭状成分に特異的な変異であるのか、②EGFR肺腺癌の悪性度、すなわち増殖活性・脈管侵襲性や予後に相関するのかを検証する予定である。この研究により、EGFR肺腺癌の高悪性度化に関わる主要な後発変異を同定し、新規の予後予測マーカーや分子標的指標の確立に繋げたい。今までに、切除材料（外科症例）のEGFR肺腺癌凍結検体から、微小乳頭状成分(20例)と非微小乳頭状成分(10例)を切り分け、この30症例に対して候補遺伝子のCDS領域をターゲットにした変異解析(amplicon panel sequence)を行った。その結果、微小乳頭状成分が多く含まれるクラスターに、p53をはじめとする複数の遺伝子変異がより多く含まれていることが示された。当該年度は、新技術である「Visium 空間的遺伝子発現解析」を用いて、組織像を対比させることで、微小乳頭状成分と非微小乳頭状成分それぞれの遺伝子発現パターンを解析し、微小乳頭状成分で特異的に発現上昇している遺伝子変異3個と、発現低下している遺伝子20個を同定した（松村舞依 他, 日本病理学会学術総会, 2023年)。