Phylodynamics of regional Streptococcus pneumoniae serotype 19A-ST320 lineage in Okinawa prefecture and the analysis of pbp1a transmission between different pneumococcal clones in Japan

沖縄県および日本本島で検出される多剤耐性肺炎球菌クローン19A-ST320株の解析の全ゲノム解析を行った。19A-ST320クローン株は本邦においては沖縄県において高頻度に検出される一方で、日本本島では検出が稀である。本研究では、全ゲノム解析を用いて、沖縄県で高頻度に検出される同クローン株が、日本本島由来で沖縄県で流行する素地があるのか、あるいは沖縄県に諸外国から流入があるのか、を解析した。全ゲノム解析の結果では沖縄株は米国で検出される同クローン株と近縁であることが判明した。ベイズ解析によるとこの流入は1990年代から2000年にかけて起こったと考えられる。沖縄県の地政学的な要素を考慮に入れると、同株は米軍基地に関連して米国より沖縄県に流入している可能性が示唆される。

沖縄県および日本本島で検出される多剤耐性肺炎球菌クローン19A-ST320株の解析の全ゲノム解析を行った。19A-ST320クローン株は本邦においては沖縄県において高頻度に検出される一方で、日本本島では検出が稀である。本研究では、全ゲノム解析を用いて、沖縄県で高頻度に検出される同クローン株が、日本本島由来で沖縄県で流行する素地があるのか、あるいは沖縄県に諸外国から流入があるのか、を解析した。全ゲノム解析の結果では沖縄株は米国で検出される同クローン株と近縁であることが判明した。ベイズ解析によるとこの流入は1990年代から2000年にかけて起こったと考えられる。沖縄県の地政学的な要素を考慮に入れると、同株は米軍基地に関連して米国より沖縄県に流入している可能性が示唆される。