Study on invasion potential of Helicobacter pylori uninfected signet ring cell gastric cancer

本研究は当院でヘリコバクターピロリ未感染未分化型胃癌での浸潤先進部でどのような遺伝子異常が起こっているかを癌ゲノム解析を用いて明らかとしていく研究である。この変化を明らかにするためにヘリコバクターピロリ除菌後未分化型胃癌の浸潤先進部でどのような遺伝子異常が起こっているかを検索しコントロールとして未感染癌の変化について明らかにする研究である。これまでに内視鏡治療もしくは手術で治療したヘリコバクターピロリ未感染未分化型胃癌36症例39病変のうち、粘膜下層以深への浸潤を認めた7症例7病変の粘膜内印環細胞癌成分と浸潤部の低分化腺癌成分をそれぞれレーザーマイクロダイセクションにて切り出し，市販の抽出キットを用いてgDNAの抽出を行った。Qubitを用いてDNA量を測定したところ次世代シークエンサーの解析に十分な量のDNAを採取することができた。また粘膜下層以深への浸潤を認めたヘリコバクターピロリ除菌後未分化型胃癌7症例7病変の粘膜内印環細胞癌成分と浸潤部の低分化腺癌成分からもそれぞれレーザーマイクロダイセクションにて切り出し，同様に抽出キットを用いてgDNAの抽出を行った。同症例においてもQubitを用いてDNA量を測定したところ次世代シークエンサーの解析に十分な量のDNAを採取することができた。さらにこれらの症例のDNAのQualityを測定するためにAgilent社のtapestationのGenomic DNAを用いてDIN値の測定を行った。さらに経年劣化によるDNAの断片化の程度を測定するためqPCRによるDNA定量をΔΔQCを用いて測定を行った。

本研究は当院でヘリコバクターピロリ未感染未分化型胃癌での浸潤先進部でどのような遺伝子異常が起こっているかを癌ゲノム解析を用いて明らかとしていく研究である。この変化を明らかにするためにヘリコバクターピロリ除菌後未分化型胃癌の浸潤先進部でどのような遺伝子異常が起こっているかを検索しコントロールとして未感染癌の変化について明らかにする研究である。これまでに内視鏡治療もしくは手術で治療したヘリコバクターピロリ未感染未分化型胃癌36症例39病変のうち、粘膜下層以深への浸潤を認めた7症例7病変の粘膜内印環細胞癌成分と浸潤部の低分化腺癌成分をそれぞれレーザーマイクロダイセクションにて切り出し，市販の抽出キットを用いてgDNAの抽出を行った。Qubitを用いてDNA量を測定したところ次世代シークエンサーの解析に十分な量のDNAを採取することができた。また粘膜下層以深への浸潤を認めたヘリコバクターピロリ除菌後未分化型胃癌7症例7病変の粘膜内印環細胞癌成分と浸潤部の低分化腺癌成分からもそれぞれレーザーマイクロダイセクションにて切り出し，同様に抽出キットを用いてgDNAの抽出を行った。同症例においてもQubitを用いてDNA量を測定したところ次世代シークエンサーの解析に十分な量のDNAを採取することができた。さらにこれらの症例のDNAのQualityを測定するためにAgilent社のtapestationのGenomic DNAを用いてDIN値の測定を行った。さらに経年劣化によるDNAの断片化の程度を測定するためqPCRによるDNA定量をΔΔQCを用いて測定を行った。