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新規タイピング手法を用いたクローン病に関連した大腸菌群の特定とその機能解析

使用新的分型方法鉴定与克罗恩病相关的大肠菌并分析其功能

基本信息

批准号：
21K15947
负责人：
大野将司
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Shiga University of Medical Science
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K15947/
关键词：
クローン病大腸菌タイピング

项目摘要

クローン病では、dysbiosis（腸内細菌叢の異常）が顕著にみられる。中でも、大腸菌の増加が特徴的である。大腸菌には多様なグループが存在するが、クローン病では接着性侵入性大腸菌（AIEC）と称されるグループの大腸菌が多く検出され、クローン病の重要な病原因子の一つとして考えられている。全ゲノムが公開されている641種類の大腸菌を用いて解析したところ、yjj遺伝子の塩基配列多型により、クラリスタリング可能なことを見出した。クローン病患者43名および健常人15名より採取した腸内細菌のDNAを用いて、この大腸菌タイピング手法をあてはめ、次世代シーケンサーで解析した。結果、2つの大腸菌のグループが、クローン病において特異的であった。この2つのクローン病に特徴的なグループの大腸菌の単離に成功し、現在、ゲノム解析を行っている。今後、これらの大腸菌をマウスに定着させるなどして、さらに詳細に解析することにより、これらの大腸菌群がいかにクローン病に対して病原性を発揮しているか検討を加える予定である。

The symptoms of illness and dysbiosis (bacteria in the interior) are not common. Add the special ones to the medium and large ones. The presence of pathogens, the presence of pathogens, the presence of sexually invasive bacteria (AIEC), the presence of pathogens, and the presence of pathogens. The whole system is open to the public. In this case, you can use the software to analyze the data, and the yjj sub-system should be equipped with a multi-type information system. There were 43 patients with disease and 15 normal people. The bacteria DNA were collected from the patients, and the techniques were analyzed in the next generation. Results: the results showed that there was no significant difference between the two groups in terms of bacterial infection and disease. This is the first time that the disease has been isolated successfully, and that it will be analyzed in the first place. From now on, you will need to know that the pathogen is not pathogenic and that the pathogenicity is not known to be pathogenic.