子宮頸癌FFPE組織を用いた16s rRNAマイクロバイオーム解析

使用宫颈癌 FFPE 组织进行 16s rRNA 微生物组分析

• 批准号: 21K16796
• 负责人: 小林 彩
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Wakayama Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K16796/
• 关键词: 子宮頸癌; マイクロバイオーム; マイクロバイオーム

進行子宮頸癌の予後は不良であり、新規治療戦略が求められている。申請者らはこれまで、婦人科癌のホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織や血液から腫瘍DNAを抽出し、次世代シーケンサーを用いた網羅的遺伝子解析を継続して行ってきた。これまでの経験を踏まえ、さらなる腫瘍特性の解明として、子宮頸癌FFPE組織からの抽出DNAを用いた“マイクロバイオーム（細菌叢）解析”という新たな視点から研究計画を立てた。近年、細菌およびその代謝物が炎症を引き起こし、炎症性疾患や悪性腫瘍の原因となると報告されているが、子宮頸癌FFPE組織を用いて腫瘍内マイクロバイオーム解析を行なった研究はまだ存在しない。本研究では16s rRNAを用いたマイクロバイオーム解析を行い、子宮頸癌組織内の細菌叢を構成する細菌種の同定および構成比率の違いを明らかにし、治療反応性も含めた臨床予後との相関をみる。さらに、遺伝子変異解析や癌微小環境解析も並行して行い比較検討することにより、新たな癌化メカニズムの解明に寄与する可能性もあり、重要な知見となる。

Cervical cancer is treated with a new treatment plan. The applicant shall be responsible for the analysis of DNA in female cancer tissue and blood tissue and for the analysis of DNA in the next generation. The study of cervical cancer FFPE tissue was carried out in a new way. In recent years, bacterial metabolites have been reported as causes of inflammation, inflammatory diseases and cervical cancer, and FFPE tissues have been used to analyze the presence of inflammatory metabolites in cervical cancer. In this study, we analyzed the use of 16s rRNA in cervical cancer tissues, identified the identity of bacterial species and their constituent ratios, and determined the correlation between therapeutic response and clinical outcomes. The analysis of genetic diversity and micro-environment of cancer is carried out in parallel with the comparative study of the possibility and importance of new cancer diagnosis and treatment.