重粒子適応難治性骨軟部肉腫の早期発見・局所制御バイオマーカーの新規高感度探索

希少がんである骨軟部腫瘍の中でも、軟骨肉腫と一部の軟部肉腫は中高年以降に多く、残された最後の治療法ともいえる重粒子線治療を適応しても、5年全生存率はいまだ低い。そこで本研究では、重粒子適応難治性骨軟部肉腫の早期発見及び局所制御に資するバイオマーカーを探索する。具体的には、DNAメチル化変化などのエピゲノム変異に着眼した。特に近年、DNA脱メチル化機構の中間体が発がん過程で重要な役割を担っていることが示唆されている。そこで、応募者らがこれまでに開発してきた高精度・高感度メチル化大規模解析法をDNA脱メチル化機構の中間体検出用に新たに改変し、高精度・高感度メチル化大規模解析法とともにこれを重粒子適応難治性骨軟部肉腫の解析に適用することで、早期発見・局所制御に資するバイオマーカーを探索する。今年度は重粒子適応難治性骨軟部肉腫のうち軟骨肉腫と高悪性度紡錘形細胞肉腫に関して、高精度・高感度メチル化大規模解析法によるデータ取得を開始した。まずパイロットスタディーとしてそれぞれの疾患で局所制御不良患者、良好患者各３名を解析した。その結果、軟骨肉腫と高悪性度紡錘形細胞肉腫の両疾患で共通して制御不良郡で低メチル化もしくは高メチル化しているすなわち重粒子適応難治性骨軟部肉腫における制御不良のマーカー候補を見出すことに成功した。またそのうちの一部に関して、インフォマティクスを用いて遺伝子部位の推定した後、シークエンサーにて同定した。

希少がんである骨軟部腫瘍の中でも、軟骨肉腫と一部の軟部肉腫は中高年以降に多く、残された最後の治療法ともいえる重粒子線治療を適応しても、5年全生存率はいまだ低い。そこで本研究では、重粒子適応難治性骨軟部肉腫の早期発見及び局所制御に資するバイオマーカーを探索する。具体的には、DNAメチル化変化などのエピゲノム変異に着眼した。特に近年、DNA脱メチル化機構の中間体が発がん過程で重要な役割を担っていることが示唆されている。そこで、応募者らがこれまでに開発してきた高精度・高感度メチル化大規模解析法をDNA脱メチル化機構の中間体検出用に新たに改変し、高精度・高感度メチル化大規模解析法とともにこれを重粒子適応難治性骨軟部肉腫の解析に適用することで、早期発見・局所制御に資するバイオマーカーを探索する。今年度は重粒子適応難治性骨軟部肉腫のうち軟骨肉腫と高悪性度紡錘形細胞肉腫に関して、高精度・高感度メチル化大規模解析法によるデータ取得を開始した。まずパイロットスタディーとしてそれぞれの疾患で局所制御不良患者、良好患者各３名を解析した。その結果、軟骨肉腫と高悪性度紡錘形細胞肉腫の両疾患で共通して制御不良郡で低メチル化もしくは高メチル化しているすなわち重粒子適応難治性骨軟部肉腫における制御不良のマーカー候補を見出すことに成功した。またそのうちの一部に関して、インフォマティクスを用いて遺伝子部位の推定した後、シークエンサーにて同定した。