权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

Development of novel psoralen conjugated triplex forming oligonucleotides and its application to a photo genome editing technology

新型补骨脂素缀合三链体形成寡核苷酸的开发及其在照片基因组编辑技术中的应用

基本信息

批准号：
22K14839
负责人：
三瓶悠
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Nagasaki University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

デオキシリボース1-位ソラレン導入型三重鎖形成核酸（Ps-TFO）の機能評価を目的とし、下記の三項目について実施した。1.　1-位ソラレン導入型デオキシリボースのアミダイト合成と核酸配列への導入：市販で入手可能なデオキシリボース誘導体を出発原料とし、10工程の合成反応を用いた構造変換により、1-位ソラレン導入型デオキシリボースのアミダイト化合物の合成に成功した。合成したアミダイトはホスホロアミダイト法によって核酸配列中へと導入し、目的とするPs-TFOの合成を達成した。2.　合成したPs-TFOの三重鎖形成能評価：合成したリンカー長の異なる二種のアミダイトをそれぞれ導入したPs-TFOの三重鎖形成能評価をTm解析システムを用いて実施した。標的二重鎖のうち、片側一本鎖にプリン塩基を多く含有する配列でないと安定した三重鎖構造形成は不可能である。つまりこのプリン豊富な一本鎖中に含まれるピリミジン塩基部位（ミスマッチ部位）は三重鎖構造の不安定化を招く原因となる。一方、今回合成したPs-TFOのソラレン導入部位を、このミスマッチ部位に相当する位置に配置し、三重鎖を形成させた場合、ピリミジン塩基との相互作用と考えられるソラレンのインターカレーションにより、ソラレン非導入型のTFOよりも形成される三重鎖構造が優位に安定化されていることが分かった。この結果は、今回合成したPs-TFOにより、三重鎖の標的配列が拡張できる可能性を示唆するものである。3.　合成したPs-TFOの架橋体形成能評価：合成したPs-TFOの標的二重鎖に対する架橋能を変性ポリアクリルアミドゲル電気泳動により評価した。その結果、ピリミジン塩基（チミン、シトシン）と効率的に二架橋体形成することが分かり、不可逆的な三重鎖構造が形成できることが分かった。

The function evaluation of Ps-TFO was carried out according to the following three items: 1. 1-The synthesis of nucleic acid alignment compounds was successfully carried out by using structural transformation in 10 engineering synthetic reactions. The synthesis of Ps-TFO was carried out by the method of DNA sequencing. 2. Evaluation of the triple lock formation of Ps-TFO: the synthesis of the first two kinds of different types of materials, the introduction of Ps-TFO triple lock formation evaluation of Tm analysis of the first three kinds of materials It is impossible to form a stable triple lock structure by arranging multiple locks on the target and one lock on the sheet side. The reason why the triple lock structure is unstable is that the base part of the triple lock is contained in the triple lock. In this case, the triple lock structure is optimized for the formation of the triple lock structure. The results show that the probability of triple lock alignment is higher than that of current synthesis. 3. Synthesis of Ps-TFO bridge formation performance evaluation: synthesis of Ps-TFO target double lock on the bridge performance evaluation As a result, the formation of efficient two-way bridges and irreversible three-way locks

项目成果

期刊论文数量（11）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Triplex stabilizing effect and photo-crosslinking ability of a novel psoralen-conjugated triplex-forming oligonucleotide

新型补骨脂素缀合三链体形成寡核苷酸的三链体稳定作用和光交联能力

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yu Mikame;Honoka Eshima;Juki Nakao;Tsuyoshi Yamamoto;Dohno Chikara;Wada Takehiko;Asako Yamayoshi
通讯作者：
Asako Yamayoshi

三重鎖形成核酸の標的配列の拡張と三重鎖構造の安定化を可能とする基盤技術の開発

开发能够扩展三链体形成核酸的靶序列并稳定三链体结构的基础技术

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
三瓶悠;江島穂乃香;中尾樹希;山本剛史;張功幸;堂野主税;和田健彦;山吉麻子;三瓶悠
通讯作者：
三瓶悠

Unique Crosslinking Properties of Psoralen‐conjugated Oligonucleotides developed by Novel Psoralen N‐Hydroxysuccinimide Esters

新型补骨脂素 N-羟基琥珀酰亚胺酯开发的补骨脂素缀合寡核苷酸的独特交联特性

DOI：
10.1002/cbic.202200789
发表时间：
2023
期刊：
ChemBioChem
影响因子：
3.2
作者：
Nakao Juki;Mikame Yu;Eshima Honoka;Yamamoto Tsuyoshi;Dohno Chikara;Wada Takehiko;Yamayoshi Asako
通讯作者：
Yamayoshi Asako

Selective Photo-Crosslinking Detection of Methylated Cytosine in DNA Duplex Aided by a Cationic Comb-Type Copolymer