車軸藻植物門ヒメミカヅキモから紐解くオーキシン生理機能の起源と進化
車軸藻植物門ヒメミカヅキモから紐解くオーキシン生理機能の起源と進化
批准号:
22K15179
负责人:
大高 きぬ香
金额:
$2.91万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31
中文摘要
本研究では、ヒメミカヅキモを実験モデルとして、祖先的なオーキシン生理機能に迫ることを目的とした。ヒメミカヅキモにおいては形質転換法が確立されているため、CRISPR/Cas9によって、既にいくつかのオーキシン関連遺伝子の変異株を得ていた。しかし、中には、遺伝子の変異の入り方が1パターンのみの変異株しかまだ得られていないケースがあった。遺伝子の変異の入り方が異なる変異株を複数株取得したかったため、形質転換の結果得られていた複数の薬剤耐性株から、さらにシーケンスによって遺伝子の変異の確認を進めた。その結果、遺伝子によっては、変異の入り方が同様の変異株が複数株見られたケースがあり、まだ全ての薬剤耐性株の変異を確認できているわけではないが、必要に応じてターゲットサイトを変更し、CRISPR/Cas9による形質転換を再度試みることについても検討する。同時に進めていた変異株の解析では、野生株と比較して異常な形態を示す細胞が見られたため、細胞の形態や生育スピード等について、より詳細に解析を進める。さらに植物ホルモンの量に影響がないかを調べるため、野生株とオーキシン関連遺伝子の変異株について、ホルモノーム解析を行った。サンプル量が少なかったせいか、以前は検出できたが今回は一部検出できなかった植物ホルモンがあるなどの問題点も見つかり、サンプルの準備方法を含めて再度検討したいと考えている。その後現在に至るまで産休・育休を取得中である。
英文摘要
本研究では、ヒメミカヅキモを実験モデルとして、祖先的なオーキシン生理機能に迫ることを目的とした。ヒメミカヅキモにおいては形質転換法が確立されているため、CRISPR/Cas9によって、既にいくつかのオーキシン関連遺伝子の変異株を得ていた。しかし、中には、遺伝子の変異の入り方が1パターンのみの変異株しかまだ得られていないケースがあった。遺伝子の変異の入り方が異なる変異株を複数株取得したかったため、形質転換の結果得られていた複数の薬剤耐性株から、さらにシーケンスによって遺伝子の変異の確認を進めた。その結果、遺伝子によっては、変異の入り方が同様の変異株が複数株見られたケースがあり、まだ全ての薬剤耐性株の変異を確認できているわけではないが、必要に応じてターゲットサイトを変更し、CRISPR/Cas9による形質転換を再度試みることについても検討する。同時に進めていた変異株の解析では、野生株と比較して異常な形態を示す細胞が見られたため、細胞の形態や生育スピード等について、より詳細に解析を進める。さらに植物ホルモンの量に影響がないかを調べるため、野生株とオーキシン関連遺伝子の変異株について、ホルモノーム解析を行った。サンプル量が少なかったせいか、以前は検出できたが今回は一部検出できなかった植物ホルモンがあるなどの問題点も見つかり、サンプルの準備方法を含めて再度検討したいと考えている。その後現在に至るまで産休・育休を取得中である。
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