疾患関連HLA多型性の分子構造解析

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先行研究におけるHLA領域におけるスギ花粉症の疾患感受性候補遺伝子については、自作の計算シートを用いて相関解析を行い、疾患感受性遺伝子の検索していた。そのため、再度、研究によく用いられている解析用のソフトを使用し、すべての結果について相関解析をやり直し、改めてHLA領域におけるスギ花粉症の疾患感受性候補遺伝子を明らかにした。結果は、自作の計算シートを用いた相関解析と同じであった。今回行った相関解析により明らかとなった、HLA領域におけるスギ花粉症の疾患感受性候補遺伝子について、ソフトを用いての統計解析や多変量解析等の解析手法により、候補遺伝子の絞り込みを行った。絞り込んだ候補遺伝子について、これまでに報告されていない新規の疾患感受性遺伝子であるかを論文検索により確認し、さらなる絞り込みを行った。以上の方法により絞り込んだ疾患感受性候補遺伝子の塩基配列を元にアミノ酸配列を決定し、これまでにデータベースに登録されているタンパク質の立体構造を用い、計算予測によるタンパク質の立体構造予測、タンパク質同士の複合体形成解析を行った。このことにより、分子の相互作用による影響をシミュレーションしようと試みた。現在は、候補のタンパク質が大きいため、タンパク質同士の分子間相互作用の影響を上手くシミュレーションすることが簡単ではなく、スーパーコンピュータを用いたりして、分子間相互作用の影響をシミュレーションできる方法を模索している段階である。