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Identification of immunotherapy-resistant biomarkers in head and neck cancer

头颈癌免疫治疗耐药生物标志物的鉴定

基本信息

批准号：
22K16927
负责人：
三澤由幾
金额：
$ 3万
依托单位：
Hamamatsu University School of Medicine
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

癌細胞の不均一性獲得は、エピゲノムによる可塑性に起因するとされている。薬剤耐性や効果予測などに関与し治療過程で変化する癌の不均一性・可塑性の解明には、原発腫瘍からの遺伝子情報よりもリキッドバイオプシーからの遺伝子情報が有利である。我々研究グループは、cfDNAを使ったDNAメチル化解析でいくつかの新規性のある報告を行った。HPV関連中咽頭癌の研究では、細胞株、臨床検体からの網羅的DNAメチル化解析にて抽出したメチル化マーカー候補の21遺伝子から、喉頭、口腔、下咽頭、中咽頭の250サンプルのDNAメチル化解析で中咽頭のみに予後と関連した10遺伝子を抽出し、さらに正常コントロールのリキッドバイオプシーでもメチル化を認める7遺伝子を除外して、CALML5、DNAJC5G、LY6Dの3遺伝子が、HPV関連中咽頭癌における有効なメチル化マーカーでcfDNAからLY6D遺伝子のメチル化が消失（脱メチル化）するという、予想とは異なる現象で、ICI抵抗性を予測するバイオマーカーになると考えられた。本研究では、最近可能になったcfDNAの網羅的メチル化解析法を使って、ICI抵抗性を引き起こす脱メチル化遺伝子の抽出を行い、ICI抵抗性に関与し治療過程で変化する癌の不均一性・可塑性の解明とICI抵抗性を克服する治療法の探索を目指す。2023年度は、HPV関連中咽頭癌細胞株UMSCC47を使って、LY6D遺伝子をsiRNAでノックダウンした後、コロニー数、浸潤能の変化を測定ついて解析を行った。また、LY6D蛋白の免疫染色をHPV関連中咽頭癌ならびにICI治療を行った頭頸部癌症例に行い解析を行った。現在、これらの解析の評価を行っている。

The heterogeneous acquisition of cancer cells is caused by plasticity. Tolerance, effect prediction, heterogeneity, plasticity, interpretation, genetic information, genetic information, etc. of cancer related to the treatment process are beneficial. I am studying the new report on the analysis of cfDNA. HPV-associated pharyngeal cancer was studied in cell lines, clinical specimens, and a network of 21 candidate DNA fragments were extracted, 250 candidate DNA fragments were extracted, and 10 candidate DNA fragments were extracted, and 7 candidate DNA fragments were extracted from normal pharyngeal specimens. CALML5, DNAJC5G, LY6D and other three genes, HPV associated pharyngeal cancer, expected to be different, ICI resistance, expected to be different, expected to be different, expected to be different. This study is aimed at exploring new approaches for the treatment of cancer heterogeneity, plasticity, and ICI resistance related to the evolution of cfDNA networks, the initiation of ICI resistance, the extraction of cfDNA fragments, and the treatment of cancer heterogeneity, plasticity, and ICI resistance. In 2023, HPV-associated pharyngeal cancer cell line UMSCC47 was detected by siRNA and LY6D gene analysis. Immunostaining of LY6D protein in human papillomavirus (HPV) is associated with the treatment of head and neck cancer. Now, the analysis of the analysis of the review is in progress.