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Identification of immunotherapy-resistant biomarkers in head and neck cancer

头颈癌免疫治疗耐药生物标志物的鉴定

基本信息

批准号：
22K16927
负责人：
三澤由幾
金额：
$ 3万
依托单位：
Hamamatsu University School of Medicine
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

癌細胞の不均一性獲得は、エピゲノムによる可塑性に起因するとされている。薬剤耐性や効果予測などに関与し治療過程で変化する癌の不均一性・可塑性の解明には、原発腫瘍からの遺伝子情報よりもリキッドバイオプシーからの遺伝子情報が有利である。我々研究グループは、cfDNAを使ったDNAメチル化解析でいくつかの新規性のある報告を行った。HPV関連中咽頭癌の研究では、細胞株、臨床検体からの網羅的DNAメチル化解析にて抽出したメチル化マーカー候補の21遺伝子から、喉頭、口腔、下咽頭、中咽頭の250サンプルのDNAメチル化解析で中咽頭のみに予後と関連した10遺伝子を抽出し、さらに正常コントロールのリキッドバイオプシーでもメチル化を認める7遺伝子を除外して、CALML5、DNAJC5G、LY6Dの3遺伝子が、HPV関連中咽頭癌における有効なメチル化マーカーでcfDNAからLY6D遺伝子のメチル化が消失（脱メチル化）するという、予想とは異なる現象で、ICI抵抗性を予測するバイオマーカーになると考えられた。本研究では、最近可能になったcfDNAの網羅的メチル化解析法を使って、ICI抵抗性を引き起こす脱メチル化遺伝子の抽出を行い、ICI抵抗性に関与し治療過程で変化する癌の不均一性・可塑性の解明とICI抵抗性を克服する治療法の探索を目指す。2023年度は、HPV関連中咽頭癌細胞株UMSCC47を使って、LY6D遺伝子をsiRNAでノックダウンした後、コロニー数、浸潤能の変化を測定ついて解析を行った。また、LY6D蛋白の免疫染色をHPV関連中咽頭癌ならびにICI治療を行った頭頸部癌症例に行い解析を行った。現在、これらの解析の評価を行っている。

The heterogeneity of cancer cells is not uniform, and the cause of plasticity is abnormal. The result of this study is that it is beneficial to understand the heterogeneity and plasticity of cancer in the process of treatment and treatment. We have studied how to improve the performance of the DNA and cfDNA to make it easier to analyze the new specifications and report lines. HPV pharynx cancer research laboratory, cell line, bed cell network DNA characterization analysis of pharynx cancer cell line, pharynx cell line, bed cell line, pharynx, pharynx and pharynx In the middle of the pharynx, there is a cancer in the pharynx, the cancer in the pharynx, The resistance to ICI was tested in the first part of the study. In this study, recently, it is possible that the cfDNA network analysis method has led to the development of ICI resistance, ICI resistance and treatment. The purpose of this study is to understand the heterogeneity and plasticity of cancer, to understand the ICI resistance and to overcome the prevention and treatment of cancer. After the pharynx cancer cell lines of UMSCC47 and LY6D were incubated in 2023 and HPV, the numbers of pharynx cancer cells were measured and analyzed. Tumor, LY6D protein immunostaining, HPV protein immunostaining, pharynx cancer, ICI treatment, cancer treatment, cancer analysis, tumor immunostaining, immunostaining and immunostaining. At present, we need to analyze the information on the line.