バクテリオロドプシンの光情報伝達機構の理論的研究

细菌视紫红质光转导机制的理论研究

• 批准号: 11740246
• 负责人: 小田井 圭
• 金额: $ 0.32万
• 依托单位: Shohoku College
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1999
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1999 至 2000
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-11740246/
• 关键词: バクテリオロドプシン; INDO; レチナール; 光異性化

(1)本研究課題は,バクテリオロドプシン(BR)で起こる早い光異性化の過程を電子論的に解明することである.このことは蛋白質の機能発現を解明するための基礎的な研究となる.バクテリオロドプシン発色団の光異性化の時間内に,光信号受容蛋白質であるBRとその発色団とがどのような相互作用しているのかを理論的に解明することが本研究課題の目的である.(2)当該年度に行った研究は,前年度に開発したINDO-CI法のプログラム及び本補助金により購入したMNDO-PM3法のプログラムを用い,明順応状態における発色団レチナールが光を吸収しK中間体状態へ移行する様子を計算した.この開発した計算プログラムでは,バクテリオロドプシン中のすべてのアミノ酸残基を点電荷としてレチナールの電場環境を考慮できる点に特徴がある.一般的に,バクテリオロドプシン発色団の光異性化過程はレチナールのC_<13>=C_<14>結合軸の異性化と考えられている.しかし当該研究者の計算結果によると,C_<13>=C_<14>結合軸およびC_<15>=N_<16>結合軸の2つの結合軸が協調してall-trans型から13-cis型へ異性化することがわかった.レチナールはこの2軸でねじれることにより,C_<13>=C_<14>結合軸の1軸のみで異性化する場合に起こる大きな立体障害を回避していると考えられる.今まで実験では明らかにできなかった,発色団の異性化過程を提出することができた.当該研究者の提出する異性化モデルは,発色団と蛋白部分との相互作用や構造的な及びエネルギー的な観点から検討したものであり,その結果,発色団の異性化の方向(回転方向)を特定することができた.本研究の成果については,現在論文を執筆中である.

(1) the purpose of this study is to demonstrate the effectiveness of the early photoluminescence (BR) in the interpretation of the process of computer theory. By using the protein machine, we can find out the research results of the basic research of the protein industry. The purpose of this study is to understand the understanding of the theory of interaction between BR and light signal capacitive proteins. The purpose of this study is to understand the purpose of this study. (2) the current year will be conducted in the current year In the previous year, the INDO-CI method was used and this grant was introduced into the MNDO-PM3 method. This method is used to determine the status of the transfer data in the system. It is necessary to calculate the amount of acid residue in the environmental assessment system, and the environmental assessment is very important. In general, it is necessary to improve the process of photosensitization. C _ & lt;13>=C_<14> is used to improve the quality of the system. When the researcher calculates the results of the calculation, the results of the calculation are as follows: the results of the calculation, the results, the results, the results. In order to improve the performance of the system, we need to know that there are many problems in the system, such as the number of people, the amount of damage, the amount of damage. Today, we are aware that there are significant changes in the process of color management. When the researcher proposed that the interaction between protein parts and the interaction between the proteins and the proteins were analyzed, the results were analyzed, and the results showed that the direction (return direction) of the color response was different. The results of this study have been reviewed and are now being reviewed in the course of implementation.