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Evolutionäre Verwandtschaft zweier elementarer Protein-Faltungen: die (betaalpha)8-barrel und die (betaalpha)5- flavodoxin-ähnliche Faltung

两种基本蛋白质折叠的进化关系：(βα)8-桶状折叠和(βα)5-黄素氧还蛋白样折叠

基本信息

批准号：
41918512
负责人：
Professorin Dr. Birte Höcker
金额：
--
依托单位：
Arbeitsgruppe Biochemie III - Protein Design
依托单位国家：
德国
项目类别：
Research Grants
财政年份：
2007
资助国家：
德国
起止时间：
2006-12-31 至 2014-12-31
项目状态：
已结题

来源：
https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/41918512?language=en
关键词：
Evolution re Verwandtschaft zweier elementarer

项目摘要

Proteine besitzen unterschiedliche Strukturformen, die aufgrund der Anordnung und Vernetzung ihrer Sekundärstrukturelemente in Faltungen eingeteilt werden. Diese komplexen Strukturen haben sich durch Rekombination aus einfacheren Einheiten entwickelt. Die Untersuchung von Verwandtschaftsbeziehungen zwischen Faltungen sowie die experimentelle Umwandlung eines Faltungtypus mittels rationalen Designs helfen uns die zugrunde liegenden evolutionären Mechanismen zu verstehen. Im Rahmen dieses Antrages soll die Verwandtschaft der beiden bedeutenden Strukturformen (βα)8-barrel und (βα)5-Flavodoxin-ähnliche Faltung untersucht werden. Das ubiquitäre (βα)8-barrel besteht aus acht βα-Einheiten, die ein paralleles β-barrel bilden. Aufgrund experimenteller Hinweise wird angenommen, dass (βα)8-barrel aus einem Vorläufer halber Größe entstanden sind. Die Flavodoxin-ähnliche Faltung besteht aus fünf βα-Einheiten, die ein paralleles β-Faltblatt mit der Abfolge 21345 bilden. In einer früheren Studie haben wir überzeugende strukturelle Ähnlichkeiten zwischen Flavodoxin-ähnlichen Proteinen und Hälften von (βα)8-barrel Proteinen festgestellt, die auf eine evolutionäre Verwandtschaft der beiden Faltungstypen schließen lassen. Die experimentelle Konstruktion (A) eines Flavodoxin-ähnlichen Proteins aus einem Halb-barrel und (B) eines (βα)8-barrel Proteins aus einem Flavodoxin-ähnlichen, sowie (C) die Identifizierung von Proteinen mit einer zwischen den beiden Faltungstypen liegenden Struktur wird diese Verwandtschaft und mögliche evolutionäre Mechanismen zur Entwicklung kompakter Proteinstrukturen aufklären.

Proteine besitzen unteriedliche Strukturformen，die aufgrund der Anordnung und Vernetzung ihrer Sekundärstrukturelemente in Faltungen eingeteilt韦尔登.这种复杂的结构是通过一种新的组合而形成的。对Faltungen的研究表明，实验性的Umwandlung是一种合理的Faltungtypus设计，有助于我们理解进化机制。Im Rahmen dieses Antrages soll die Verwandtschaft der beiden bedelden Strukturformen（βα）8-barrel and（βα）5-Flavodoxin-ahnliche Faltung untersucht韦尔登.普遍存在的（βα）8桶最适合于βα-Einheiten，这是一个平行的β桶bilden。最后，实验员欣韦瑟（Hinweise）说，（βα）8管的前翼是一个很好的选择。Flavodoxin-ahnliche Faltung besteht aus fünf βα-Einheiten，die an paralleles β-Faltblatt mit der Abfolge 21345 bilden.在一个早期的研究中，我们对8-桶（βα）蛋白质进行了Flavodoxin-ahnlichen Proteinen和Hälften的结构分析，发现了一种进化的方法。通过对（A）半桶型黄素氧还蛋白和（B）八桶型黄素氧还蛋白的实验结构的分析，表明（C）蛋白质的结构鉴定是一种复杂的蛋白质结构的进化机制。